本系創立於1971年，由美籍傳教士羅芳華博士，聘請國內外菁英，以嚴謹之教學理念奠定紮實基礎，學理與展演並重。師資陣容堅強，專任教授多擁有歐美博士學位。重視國際化教育環境，定期邀請國內外演奏家至校內演奏、演講、座談及示範教學，提供觀摩與互相切磋之學術環境，協助學生發揮最大音樂潛能。此外，於113學年度開設「音樂治療」組，培養人才及增強音樂應用於社會服務技能，並且促進跨領域人員多元學習。

以代表性的南管樂、北管樂、古琴、琵琶，結合音樂理論為五個主修項目。以保存、傳承、研究並發展傳統音樂為宗旨，兼融傳統與現代，發展精緻傳統音樂。從在臺灣流傳廣泛的樂種，延伸至亞洲傳統音樂的學習，並積極開發傳統音樂於當代社會的發展和應用，以培養具本國音樂專業技藝、國際文化視野的新世代音樂人才。

本系為西方古典音樂學系，以培養音樂相關領域專業演奏(唱)、創作人才為目標。樂器組別包括鋼琴、電子琴、聲樂、弦樂、管樂、打擊樂與作曲。另設「音樂治療組」，另設「音樂治療組」，以理論為基礎，實作為輔，培養本土音樂治療專業人才。

「傳統音樂」與民族的社會生活及文化涵養有密切的關係；本系的教學內容包括臺灣、中國與亞洲的音樂傳統，傳承傳統音樂的智慧與技藝，並融入當代藝術發展與社會生活。

[演奏唱、作曲組] 提升個人演奏(唱)專業能力、具備充足的基礎樂理知識。
[音樂治療組]培養日常觀察人在不同環境中的音樂行為、紀錄方法，並增進評論、分析與自省的能力。

不論是觀察與實作、講解與討論、展演製作及推廣教學實習或是小組創編能力訓練，同學須能自發性且積極投入高中端的各項課程學習或活動參與，亦要培養提問、思考與勇於嘗試的習慣。

演奏(唱)及作曲組整體課程設計著重獨立思考與創意啟發，目標為培育具國際視野的專業音樂人才，奠定日後進入職場所需的良好基礎。
音樂治療組著重理論與實務結合，透過聆聽、律動、歌唱、敲擊及臨床即興技巧，協助進行自我覺察及各類身心障礙者的了解，做適當的音樂活動設計，未來投入助人者工作。

本系與「國樂系」（中國音樂系）本質上全然不同。國樂系是以交響化後的中國樂器及其相關理論為其課程建構，本系是全國唯一將臺灣兩大重要傳統樂種南管與北管列入主修的音樂系，教師包括國寶藝師；此外也以中國兩件代表文人與庶民的重要獨奏樂器古琴與琵琶為主修項目，又為了厚植前述展演相關的研究基礎，另設有音樂理論組。

音樂系學生在求學過程中，所培養的專注力、組織能力、應變能力、創造力、美感鍛鍊以及解決問題的能力，在進入職場後，即使是非音樂類的工作，亦能迅速掌握要點，成為成功的典範。
音樂治療不是單指音樂聆聽，亦非音樂輔療、音樂陪伴，而是需要透過專業課程培育，取得正式學位，並具有實際臨床經驗後，才能從事的助人工作。

出路狹窄？本系注重培養學生多項能力，足以因應專業或往其他方向發展職涯。
傳統音樂LKK? 現在的古典音樂是以前的流行音樂，傳統音樂的特色是會跟著一代代年輕人不停演變，同時還能保有原來的音樂DNA。年輕人演奏的傳統音樂會改變它並注入自己的新生命和時代性。

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各項樂理課程的核心目標是裝備學生學習音樂的基本能力, 從讀譜、視奏、分析、到應用、更進一步與演奏能力相輔相成，培育出具備份專業智能與演奏能力的音樂專才。

本系最常被誤解的是南北管主修，非單一樂器，而是多種樂器和演唱的學習。其方式亦非照譜唱奏，而是口傳與寫傳並用，從模仿、學習基本旋律/節奏開始，熟練後培養即興能力。使用的樂譜是很酷的工尺譜，而不是簡譜。
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本系有兩大目標：
一、給學生紮實的音樂基礎教育，例如樂理、音樂史、樂曲研究、語韻學，嚴謹程度比照歐美一流音樂學府。
二、安排校內外及國際演出機會，並與國際級大師、國內外學生團體同台演出，讓學生參與多姿多采、豐富的舞台展演。

傳統並非一成不變的古板，亦非遙不可及的櫥窗化石。深耕在地傳統，往往是連結世界最好的跳板。相較於一般的音樂系或國樂系，傳統音樂學系的學生們，更有優勢帶著自己的聲音與文化，再加上跨領域、跨文化的學習視野，行走於世界各地，被全球化下的世界看見。
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