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奠定學生生物領域學科之基礎與農業生產的專業知識。
培養學生活用專業知能，因應國家社會需求，研發新品種與創新農業科技。
培養學生前瞻世界農糧供需與生物科技之發展趨勢，解決人類面臨之農業問題與危機。
培養學生誠樸精勤的精神，啟發善用自然資源的理念，落實社會關懷與推廣服務工作。

食品暨應用生物科技學系為結合理論與實務之應用學科，因此本系自成立以來，即秉持教育英才之理念，建構「食品興傳統，生技創潮流」之卓越教學與學術研究環境為宗旨。在教育目標上，以培育食品加工與工程、保健營養與食品化學及食品微生物與生物技術之人才為首要。本系在師資陣容、研究設備、研究成果及培育學生素質各方面，一直為本校農資學院中最優秀的學系之一，在國內食品相關科系中佔有舉足輕重之地位。

提昇農藝科技、發展現代化農業，善用自然資源，創新品種，培養具備理論基礎與應用技術之專業人才。

本系系名為「食品暨應用生物科技學系」，為國立中興大學歷史最悠久的學系之一，在教學及研究上共分為食品加工工程、保健營養與食品化學、食品微生物與生物技術等三大學群，分別針對其教學及研究領域開設相關課程，結合傳統食品科學與現代生物科技的應用，提供學生在食品暨應用生物科技領域全面且多元的學習。

一、修課紀錄：著重英文、化學、生物等科目選修與成績表現。
二、課程學習成果：著重修習生物、化學等課程之專題成果或與科學領域相關研習之書面報告／實作作品。
三、多元表現：著重與本系相關的學科表現（生物、化學、英文）、社團活動經及競賽成果，另可檢附學生認為有利審查之資料。

(1)高中學習歷程反思：具體說明學習歷程與未來就讀本系之關聯性，如：具有優異自主學習能力，且具特定領域之自我學習經驗及成果，從中思考您是否有興趣或適合就讀本系。
(2)就讀動機：具體陳述對本系了解程度與興趣，並說明您自身適合就讀本系之理由，如:您的人格特質、強項能力如何適合本系;本系學習資源/課程特色/研究領域吸引您之處。
(3)未來學習計畫與生涯規劃：說明個人在食品生技領域的潛力、未來升學或就業規劃之關聯。

農藝學系主要以食用與特用作物為主，植物栽培、能源、藥用新興作物，從事育種、生態農業、有機農業、組培等研究，往農學研究、生態農業、生物科技等方面進修。
園藝學系則以園藝作物栽培、景觀規劃設計、園藝產品處理與加工、生物技術、種苗生產技術為主體；兩系基本學科大致相同，主要研究方向不同。

與本系相關科系如食品科學系、水產食品科學系、食品營養學系、食品保健系等，在課程規劃上各有異同和重點，本系課程教學及研究則包含食品加工工程、保健營養與食品化學、食品微生物與生物技術等三大領域，本系開課數量及領域更為周延完整，提供學生更完整多元的學習。

很多人認為 農藝系畢業只能當農夫、經營農場或公務人員...
其實，農藝系畢業出路廣泛，糧食作物研究熱門，組培、生物科技研發、農業專業技術等在國內外都有相當穩定的就職選擇。
可以成為研究人員、學者專家、實業家，發展多元不受限制!

本系學士班畢業生在生涯發展上目前大部分選擇繼續升學，證照考試上食品技師、乙丙級技術士為主。就業方面包含食品科技業、醫療保健、一般產業及公職等，發展方向多元，不單單侷限在傳統的食品加工產業。於升學發展上學生有多元的選擇，學生依個人之生涯規劃轉換領域進修生醫所、生物科技所、農化所等相關研究所。

高中生易誤解農藝以農業領域公務員為重點培養。農藝學研究糧食作物，範疇包含中草藥、纖維特用作物、茶咖啡等。從土壤學、病蟲害認識農業氣象，從植物學延伸到作物學、作物生理生產概論，並從遺傳學延伸到植物育種方法。且為證明研究結果，延伸向試驗分析、基因鑑定技術、以及統計學、試驗設計、生物資訊等多元領域。

在本系課程規劃上涵蓋「食品加工工程、保健營養與食品化學、食品微生物與生物技術」三大領域，常有高中生誤以為課程著重食品加工或烘培等方面，其實本系大學部學生在學習上多元而廣泛，可提供後續生涯發展之多元選擇。

本系畢業生具有作物栽培、管理、改良及試驗之知識，因此幾乎所有與植物、作物、生物及農業相關領域之工作機會，均符合本系畢業生求職之範圍。

本系教育目標為「培育食品科技及生物技術領域之實務人才」。並使學生具備「食品科技及生物技術領域之專業知識及技能、了解食品科技及生物技術領域之專業實務、培養食品科技及生物技術領域之全球化視野、培養邏輯思考、溝通協調能力及團隊合作精神」之核心能力。師資陣容上具備完善的師資陣容及教學設備，提供學生在各個食品科技領域上充實的知識及技能。