本系教學著重培養食品工業技術人才，期能擔負食品之加工、製造、分析、檢驗、管理和生產等任務。本系也以「培養五育均衡發展、理論與實務兼具之國際化專業人才」具有高度關聯性，且呼應理工學院的教育目標「培養具備基礎科學知識以及專業技能，同時尊重多元文化及兼具國際視野之優秀人才」為教育目標與學校教育目標。

為培育學生兼具食品加工工程、分析檢驗、品管及研究發展能力，另充實保健食品、新興技術、生物資源開發及資訊應用等多樣化課程，訓練學生成為具有吸收最新食品資訊及生物資源應用能力的專業人才，以符合新世紀食品產業需求。

食品科學系的教育目標
1.訓練可應用原物料及生物資源的調查能力。
2.培養食品科學相關技術。
3.培育食品經營管理者的專業知識。
4.養成多元與持續的學習熱忱，正確的工作倫理及責任感。

食品科學是一門應用科學，探討食品相關知識，學習食品相關加工與包裝技術、檢驗分析能力、新產品開發、食品衛生及安全管制系統等，進而培育專業的食品科技人才。

在閱讀各個基礎學科與知識時，除了基礎的原理外，需要更深究其應用面，如何應用這個基礎知識在製程與應用上，此外，因為學科內容豐富且具一定廣度，因為需要具備歸納與融會貫通的能力，可以透過參加自然科學專題來加強這項能力，透過自己發現問題，嘗試解決回答它，將有助於提升自己的觀察力，歸納與融會貫通的能力，同時也能培養實作的實力。

食品科學是一門基礎學科與知識，除了基礎的食物原理外，需要更深究食品加工的應用面，如何應用食品加工讓食物延長保存時間外，也需要具備歸納與融會貫通的能力，可以透過參加專題製作來加強這項能力，此外，與國際接軌一直是本系學生需要具備的能力，因為需要提升英文的聽說讀寫能力，以降低未來在面臨英文授課時的壓力。

本系也針對地方傳承永續發展且創造產業特色，以下列三項目標培育人才。
(一) 針對金門農業特產，培育農產品加工，生產之人才。
(二) 配合地區特色，培養酒類釀造，生產和分析之人才。
(三) 配合國家發展計劃，培養發酵技術人才。

營養科學始於探討食物中營養成分，經消化、吸收、代謝、利用後，對人類(不同性別、年齡、健康狀況、特殊生理狀況、人群特色、社經環境等)的身體健康、功能之影響。營養科學之範疇由上述起點進行深入的基礎生物醫學研究，至預防醫學、臨床醫學、流行病學、營養推廣教育、個人化或團體之營養評估、膳食設計、政策制定等。

畢業生出路有食品產業相關專業人員例如研發,品管及衛生管理人員,不是廚師或烘焙師但是若有興趣也可往此發展,但本系的授課主要是培育食品科學的專業知識,而不是廚藝及烘焙訓練為主。

營養師須修畢社區營養實習及醫院實習學分共480個小時。本系不能報考營養師，本系可考公務人員高考-食品技師證照資格

食品科學系常被誤解為烘焙或餐飲,食品科學系強調以科學的方法,解決食品領域所面臨的問題與困境,開發新產品,提供新技術。

營養學系主要為學習大量食物製備及團體膳食製作。餐飲系則是中西餐烹飪製備及廚房原物料管理。以上2系皆非本系主要學習目標，本系主要學習目標為學習食品加工與工程，探索食品化學，認識食品衛生安全為主。

食品加工、食品衛生安全、新產品開發及食品分析等為本系學科的重點。

本系學生畢業後職業包含政府機構(衛生福利部,農業委員會農糧署),食品研究及檢驗單位研究人員,各大食品公司產品研發人員,品保工程師,生產主管等.
附件是本系學生畢業職涯圖
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