本系以培育具實務經驗之優秀植物醫學科技人才為目標，除核心基礎課程外，尚致力於培養學生田間植物疫病蟲害與營養診治之實務經驗。畢業生可經國家考試就業於政府之農業相關機構，亦或私人企業從事各類生物或化學藥劑等植物醫學資源之開發與利用，或可自行創業擔任農藥從業人員；又或至相關領域之研究所繼續深造。

本系之特色為培育微生物、免疫、生物醫學及生物藥學產業發展及研究所需之人才，課程規劃以培養生具有堅實的微生物、免疫學、細胞生物、生物藥學等基礎知識，並配合實作課程使知識與技術並重。本系專業選修課程包括微生物免疫學程、生物醫藥學程、生技醫藥產業學程等三種專業模組，使學生增進醫藥生技產品開發與微生物產品開發應用等跨領域整合之能力，奠定學生在微生物、細胞生物學基礎研究及生物醫藥產業界發展的競爭力。

「植物醫學系」意旨本系所涉及之學科與「植物保護」領域息息相關；因此探討植物本身之學科如普通植物、植物生理、植物病理與病原學等皆為必修課程，而其他可能與植物生長發育相關聯者如經濟昆蟲、土壤養分等學科亦為本系同學需具備之基礎知識。除理論外，本系亦有植物病蟲害診斷等課程，以此訓練同學們之田間實務判斷能力。

本系教學與研究重點涵蓋「新興微生物科技」、「醫藥微生物」、「生物醫藥」、「藥物研究與開發」、「中草藥萃取與分析」、「免疫工程」、「整合免疫」與「微生物應用」等領域。

因本系性質關係，同學們可利用課餘時間至田間多瞭解目前台灣農業之現況，或多閱讀相關之植物醫師、防檢疫與外來種等相關新聞與課外讀物；並可參照必選修課目冊內之學科，預先瞭解本系四年所需修習之課程。

在閱讀各個基礎學科與知識時，除了基礎的原理外，需要更思考可能的應用面，如何應用這個基礎知識在健康保健與生醫產品製程與利用，此外，因為學科內容豐富且具一定廣度，因為需要具備歸納與融會貫通的能力，可以透過參加科學專題來加強相關能力，學習過程中透過發現問題並嘗試解決，將有助於提升自己的觀察力，歸納與融會貫通的能力，同時也能培養動手做的實力。此外，吸收新知以與國際接軌一直是生命科學相關領域需要具備的能力，提升英文的聽說讀寫能力，可強化未來面臨英文授課以及研讀文獻時的壓力。

「植物病理學系」以植物病理為主軸，探討作物病原、微生物與病害綜合防治；「昆蟲學系」則以昆蟲為核心，研究其構造與生理機制等基礎學科及與其相關之應用；「植物病理與微生物學系」之研究主要涵蓋植物病理與微生物兩方面。本系囊括之範圍較廣，除上述之植物病理、昆蟲與微生物外，尚包含土壤及作物營養診斷等學科。

與農學，醫學，生命科學相關的科系都與本系有所相關，如：生物技術、生物科技、生化科技、生命科學、醫事檢驗，農業生技等。但最大差異在於本系著重對微生物學、免疫學與藥物學應用於醫藥、生技、健康、農林漁牧等領域之專業知識與技術學習，此外微生物免疫與生物藥學系比其他學系更重視跨領域之科學實驗實作、研究方法、成果展現與報告，更重視生技醫藥與健康醫療開發。

事實上，本系具有扎實的微生物及昆蟲相關技術的操作訓練及理論課程，畢業後出路寬廣，舉凡生命科學領域的研究、教育和管理工作，皆可勝任；此外大學教育著重在人的素養養成，本系同學跨領域就業者眾，也多有良好發展。

本系雖有開設醫藥、檢驗相關課程，但報考藥師、醫檢師執照者依法規需藥學系及醫事檢驗系畢業始具考試資格。

有些人會誤解植物醫學系雖然是農學院裡的科系，但大學僅有象牙塔中的理論課程，無法提供實務經驗的累積。
事實上，植物醫學系安排了各種實驗課及實習課程，需要學生動手操作，並養成仔細觀察的習慣及解決問題的方法；大四起，開設診斷及實務管理課程，學生須跟老師一齊走出學校，實際操作田間診斷及管理方法等；另畢業前，

本系雖然有開設微生物學實驗、臨床檢驗技術實習，但無受病原微生物感染之風險。

政府近年規劃推動「植物醫師制度」，期望透過訂定植物醫師法及國家考試，選出專業、經過認證的植物醫師開立簽證、提供全方位植物健康診療服務；目前已有100位儲備植物醫師在各地農會執業，成效良好，在市場有需求情況下，植物醫師名額將逐年上升。本校植物醫學系為植醫培育之搖籃，系上教師除學術成果豐富，也多有田間實務經驗，畢業生投入植物醫師職業者也獲地方好評。歡迎有志向植物保護或植物健康管理領域鑽研者加入本系。

以從事生命科學學習而言，不同於其他系所，進入本系之後可選擇本系相當多元的教師從事專題研究或實務專題，包含微生物、免疫、生物醫藥等相關研究與應用。其他詳情請參考本系網頁。

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