本系所之設立旨在培育動物科學專業科技人才，並配合國家經濟發展及國際趨勢。整合科技理論與動物產業應用，並著重實務操作之訓練，以提升學習者在動物產業的智能與實作能力。

本系以培育具實務經驗之優秀植物醫學科技人才為目標，除核心基礎課程外，尚致力於培養學生田間植物疫病蟲害與營養診治之實務經驗。畢業生可經國家考試就業於政府之農業相關機構，亦或私人企業從事各類生物或化學藥劑等植物醫學資源之開發與利用，或可自行創業擔任農藥從業人員；又或至相關領域之研究所繼續深造。

本系專業課程主要以經濟動物產業發展趨勢與科技發展為主軸，規劃四大學程模組課程。包含動物解剖生理、動物營養、遺傳育種、飼養管理、動物產品加工、動物行為與福祉等，並依科技趨勢與社會需求彈性調整課程。

「植物醫學系」意旨本系所涉及之學科與「植物保護」領域息息相關；因此探討植物本身之學科如普通植物、植物生理、植物病理與病原學等皆為必修課程，而其他可能與植物生長發育相關聯者如經濟昆蟲、土壤養分等學科亦為本系同學需具備之基礎知識。除理論外，本系亦有植物病蟲害診斷等課程，以此訓練同學們之田間實務判斷能力。

本系注重理論與實務結合，及團隊合作精神，高中學生在校時應注重實習課程操作，並可組成讀書會或研究小組，訓練團隊合作精神。

因本系性質關係，同學們可利用課餘時間至田間多瞭解目前台灣農業之現況，或多閱讀相關之植物醫師、防檢疫與外來種等相關新聞與課外讀物；並可參照必選修課目冊內之學科，預先瞭解本系四年所需修習之課程。

系為早期之畜產學系，學習課程以經濟動物的日常照護為基礎，規劃五大領域課程，包含動物生理基礎領域、動物營養與飼養領域、動物遺傳育種領域、動物產品利用領域及經營管理與休閒領域，以培育學生具備有動物繁殖與生物技術、飼養經營管理之實務經驗與專業技能及畜產品加工技術，從牧場到餐桌之過程都可參與學習，舉凡與動物相關之生活所有層面，皆可歸納於動物科學系，尤其特別著重實務操作之訓練，增進未來台灣動物產業能力。

「植物病理學系」以植物病理為主軸，探討作物病原、微生物與病害綜合防治；「昆蟲學系」則以昆蟲為核心，研究其構造與生理機制等基礎學科及與其相關之應用；「植物病理與微生物學系」之研究主要涵蓋植物病理與微生物兩方面。本系囊括之範圍較廣，除上述之植物病理、昆蟲與微生物外，尚包含土壤及作物營養診斷等學科。

擔任經濟動物飼育專業人員的確可以讓動物科學系學生發揮所長，但本系學生在學期間會接受遺傳育種、營養、生理、農場經營管理及動物產品加工等相關專業知識與實務操作技術，因此就業管道包含：公務機關、私人及財團法人機構、研究單位等，若有修習教育學程，通過考試甄選後也有機會擔任教職人員。

事實上，本系具有扎實的微生物及昆蟲相關技術的操作訓練及理論課程，畢業後出路寬廣，舉凡生命科學領域的研究、教育和管理工作，皆可勝任；此外大學教育著重在人的素養養成，本系同學跨領域就業者眾，也多有良好發展。

外界常以為動物科學系就是雞、豬、牛等動物飼養的勞力工作，此觀念已不符現今動物產業的生產模式。現代化經濟動物產業高度自動化。仰賴勞力部分極少，生產規模、產值都不可同日而語，畜牧業薪資待遇較一般大學畢業生為高，舉凡營養、繁殖、飼料製造、產品行銷等從業人員的專業能力，均亟需具備動物專業知識與技能的人才。

有些人會誤解植物醫學系雖然是農學院裡的科系，但大學僅有象牙塔中的理論課程，無法提供實務經驗的累積。
事實上，植物醫學系安排了各種實驗課及實習課程，需要學生動手操作，並養成仔細觀察的習慣及解決問題的方法；大四起，開設診斷及實務管理課程，學生須跟老師一齊走出學校，實際操作田間診斷及管理方法等；另畢業前，

本系在專業課程設計理念著重在培養學生動物科技專業知能與實作技術能力。另外本系擁有一規模完善的動物試驗場，所以利用本系動物試驗場提供之相關設施，能充分配合系上課程教學實習及老師們的計畫研究。使學生能有機會進行理論與實務結合之驗證，這一向是系一貫的教學核心與特色。

政府近年規劃推動「植物醫師制度」，期望透過訂定植物醫師法及國家考試，選出專業、經過認證的植物醫師開立簽證、提供全方位植物健康診療服務；目前已有100位儲備植物醫師在各地農會執業，成效良好，在市場有需求情況下，植物醫師名額將逐年上升。本校植物醫學系為植醫培育之搖籃，系上教師除學術成果豐富，也多有田間實務經驗，畢業生投入植物醫師職業者也獲地方好評。歡迎有志向植物保護或植物健康管理領域鑽研者加入本系。

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