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以培育學生成為水產養殖與生物科技之專門技術與研發人才為目標。大學部以基礎養成教育與專業訓練為二大主軸，分為養殖與環境、水產生物、營養飼料、病理與免疫、管理與系統分析及分子生物技術等六大專業學門領域，完整涵蓋水產養殖產業之所有專業技術。另配合六大學門教學開設相關實驗教學課程，並於本系附屬「水生動物實驗中心」提供學生極佳之實務操作學習空間，培養學生成為學理及實務兼俱之水產養殖專業人才。

「能源與冷凍空調」組以培育冷凍空調專業技師與技術人才為主。目前全國僅兩個系所具備培訓此類技術人才，本系為研究型大學唯一設組專門培育單位。面對科技社會，生活環境中不論是建築或生產加工保存運輸等，對冷凍空調的需求不斷增加，尤其有效運用能源減少浪費更是現今科技社會所面對與處理。本組主要培養冷凍空調專業技術人才，並提供台灣南部地區技術型高中「冷凍空調科」畢業生專業進修管道.

水產養殖學科定義：指利用水域，人工養殖各種有經濟價值的水生動植物以取得水產品；是廣義農業的重要組成部分，也是漁業（按生產特徵即分為養殖業和捕撈業）重要的類別之一。

能源與冷凍空調」組以培育冷凍空調專業技師與技術人才為主。面對科技社會，生活環境中不論是建築或生產加工保存運輸等，對冷凍空調的需求不斷增加，尤其有效運用能源減少浪費更是現今科技社會所面對與處理。

建議可於高中階段多加強英文、生物與化學學科之學習外，課後可多關注與養殖、生技產業之相關議題及報導，透過前往水族館或養殖等相關場域來瞭解自己的興趣方向。本系係屬於理論與實務相互應用的科系，需要做中學，所以需要保有對生物的熱情及實務操作的積極度，且需要具備觀察力、發現問題及解決問題的能力，可透過參加科學專題來加強這些能力。

各類競賽之表現。

水產養殖學系簡稱為養殖系，教育目標相當明確，歸屬於「生物資源」學群，「海洋資源」學類；相較於其他生物資源學群之相關科系，本系學習的領域著重在水生生物及養殖相關領域，更具備專業性，具論理與實務合一之海洋特色學系，且其所學能實際應用於水產養殖或生物科技相關產業。

本系非師資培育組。1.主要培養學生考取冷凍空調甲級技術士、冷凍空調技師等國家專技證照之能力。2.培育能源、冷凍空調與環境控制等產業所需，理論與實務兼備之高級技術與研發人才。

出路包括：現場養殖、水族公司、海洋博物館、飼料研發、水產品檢驗或行銷、生物技術相關產業等；也可往相關公部門（如：農委會、漁業署、水試所、各縣市政府漁業課、各區漁會）或相關教育或研究機構發展。具高度專業性且又可跨足其他生物領域；包括智能養殖、離岸風場海域環境、海洋生物復育、智慧魚電共生等跨領域。

學生可選修能源與冷凍空調選修課程強化專業技能。亦可選修資訊科技或生活科技與訓練選修課程，強化資訊與控制實作能力。學生若參加師資培育中心取得師培生資格，則可取得技術型高中能源與冷凍空調教師專業學分證明。學生畢業後可參加冷凍空調技師國家考試，或進入能源與冷凍空調相關產業就職。

水產養殖課程涵蓋了養殖與環境、水產生物、營養飼料、病理與免疫、管理與系統分析及分子生物技術等六大專業課程，是一門相當專業與廣泛的農業相關技術學門，且理論與實務並行；除需具備許多的專業知能及實務經驗外，也逐漸導向智慧農業方向發展，已與傳統養殖產業僅透過經驗傳承方式截然不同。

本系與台灣區冷凍空調工程工業同業公會建立產學合作，在本系建置冷凍空調甲級檢定場所，將於106年8月正式成立。為台灣南部唯一的檢定場所。可提供本系教學與學生學系訓練使用。

建議高中生可以從學系專任師資專長協助瞭解學系。

能源科技是以基礎能源科技為主，並朝向建築節能為主軸的相關能源科技人才。透過能源科技課程提供冷凍空調組學生建立能源科技系統觀，對冷凍空調的學習與未來技術提供完整的架構。