因應科技與社會多元化的趨勢，自98學年度成立雙專長之原科院學士班，結合本院內各系所在能源與環境領域的特色課程，以及本校各院系在其他領域之整體優勢，學生可依志趣，自由選擇本校任一學系如電機、材料、化工、經濟甚至音樂等為第二專長，提供學生先學習再選擇專長領域的彈性並賦予π型人所具備的職場競爭力。透過創新思維與多元環境，培養跨領域整合且具有國際視野的博雅科技菁英。

本系提供尖端海洋能源以及高科技產業鏈之多領域教學與研究，特色為船舶海洋工程、應用力學、光電、機電及資訊等多領域科技人才培育。畢業生皆能於離岸風電、智慧機械、船舶及海洋科技、半導體、光機電、資訊等領域深造與就業，多元發展，出路極佳。

雙專長乃本校獨創彈性且跨領域學習設計，優勢是使同學能在必修128學分下修習雙專長，不會增加同學的畢業學分數及修業時間。透過紮實的雙專長學習，讓同學能奠定良好的數理基礎，及具備廣泛的工程知識，最重要的是同學的跨領域能力足以能夠做更深入的學術研究及應用發展，如此才有能力面對未來科技的挑戰，成為領袖級的菁英人才。

「工程科學」為工程及科學的結合，科技與系統整合係工程科學主要目標，本系的教學研究特色為科技與系統整合，強調具備科技與系統能力的跨領域專業科技人才培育，教學研究領域涵蓋船舶海洋工程、應用力學、光電、機電及資訊等領域之基礎課程及專業領域進階課程。

本班課程綜合工程及環境各類學科基礎，引導學生多元探索與跨域學習。因此，鼓勵學生可參與科學領域相關課程學習及跨領域探究活動。此外，並注重學生長期參與社團、課外活動或競賽活動中的學習脈絡與領導經驗與反思。

本系著重於數學、物理、等領域科目及加深加選選修表現。高中在學期間與工程科學及海洋工程領域相關科目之書面報告、自然科學領域探究與實作成果，或特殊類型班級之相關課程學習成果。

第一專長為原子科學院內專屬的能源與環境課程，其中能源課程以低碳綠色能源如核能、太陽能、氫能為核心，環境課程則注重化學基礎，並強調永續環境相關課題，如環境對人體的健康、奈米材料在環境上的應用、全球污染物分布；第二專長可依學生的性向與志趣或與第一專長之結合性，任選本校其他系所之核心課程，並有10個學院43個領域可供選擇。
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工科海洋系與機械系、電機系等相關科系的不同在於本系著重多領域學習，課程涵蓋海洋工程、應用力學、光電、機電及資訊等多領域整合。

雙專長的課程確實比單一科系來的繁重，但同學們在大學四年可透過一二專的修讀，找出自身的優勢與興趣。在雙專長的訓練下，畢業時同學會選擇某一專長的研究所繼續就讀。本班學生第一專長能源第二專長材料，推甄上陽明交大學電子所；第一專長能源第二專長電機，輔系物理系，錄取清大核工所、通訊所、物理所，以及台大電信乙等
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1. 學生易混淆本系畢業生只能從事船舶海洋工程領域相關工作。
2. 學生易混淆本系畢業生只能從事高科技產業鏈相關工作。
3. 本系未來出路涵蓋非常廣，如離岸風電、智慧機械、船舶及海洋科技、半導體、光機電、資訊等尖端海洋能源以及高科技產業鏈領域深造與就業，多元發展，國內外產業就業機會極佳。

院學士班就是在學核能嗎？本班供完整的低碳能源課程，含太陽能、核能、氫能，核能僅是本低碳能源課程之一，相較外校的系所，本班有更完整的核能課程提供，可拓展同學在低能源領的學長光譜。

本系教學目標乃在提供多專業及多領域科技之基礎工程教育，以及多種專業學程學習環境。同時並融入總整式課程，重視理論與實務整合訓練。

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本系就工學院其他科系而言更加著重於多領域學習，課程涵蓋海洋工程、應用力學、光電、機電及資訊等多領域相關課程。在學程規劃上，大一大二以基礎課程為主，其中各教學領域擬定一至二門必修課，除可協助學生選擇志向外，也具促成多專長與多領域之教學目的，大二以後，學生可依自己的專業能力發展選擇相關領域進階專業課程，成為具備科技與系統整合能力的多領域專業科技人才。

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