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本系是臺灣唯一的土壤環境科學系，擁有堅強之師資陣容及完善的設備，教學與研究方向已由早年基礎之土壤及肥料，逐步增擴以涵蓋土地利用與改良、微生物肥料、農業剩餘副資材再利用、土壤與地下水污染整治、資源保育利用、奈米科技、環境生態、土壤碳匯及智慧農業等。

食品暨應用生物科技學系為結合理論與實務之應用學科，因此本系自成立以來，即秉持教育英才之理念，建構「食品興傳統，生技創潮流」之卓越教學與學術研究環境為宗旨。在教育目標上，以培育食品加工與工程、保健營養與食品化學及食品微生物與生物技術之人才為首要。本系在師資陣容、研究設備、研究成果及培育學生素質各方面，一直為本校農資學院中最優秀的學系之一，在國內食品相關科系中佔有舉足輕重之地位。

土壤是孕育萬物最重要的場所，沒有健康的土壤環境就沒有安全的糧食供應，本系在教學及研究涵蓋農業生產與環境保護兩大範疇，以改善土壤理化環境及微生物生態來增進農業生產，領域分為：環境微生物與生態、土壤肥力與植物營養、環境化學與污染防治、環境資源與資訊四領域，培養學生兼顧基本學理，專業知識及實際操作能力。

本系系名為「食品暨應用生物科技學系」，為國立中興大學歷史最悠久的學系之一，在教學及研究上共分為食品加工工程、保健營養與食品化學、食品微生物與生物技術等三大學群，分別針對其教學及研究領域開設相關課程，結合傳統食品科學與現代生物科技的應用，提供學生在食品暨應用生物科技領域全面且多元的學習。

除了基礎學科與知識外，需要更注重其實作及應用面，可以透過參加科學專題來培養觀察力，加強歸納與融會貫通的能力，透過自己發現問題，嘗試解決回答它，培養動手做的實力，此外，與國際接軌一直是土壤人需要具備的能力，因為需要提升英文的聽說讀寫能力，以降低未來在面臨英文授課時的壓力。

(1)高中學習歷程反思：具體說明學習歷程與未來就讀本系之關聯性，如：具有優異自主學習能力，且具特定領域之自我學習經驗及成果，從中思考您是否有興趣或適合就讀本系。
(2)就讀動機：具體陳述對本系了解程度與興趣，並說明您自身適合就讀本系之理由，如:您的人格特質、強項能力如何適合本系;本系學習資源/課程特色/研究領域吸引您之處。
(3)未來學習計畫與生涯規劃：說明個人在食品生技領域的潛力、未來升學或就業規劃之關聯。

本系為全國唯一研究土壤與環境之科系，且是全國第一個進行土壤調查、土壤污染、與土壤碳匯研究的科系。本系與地球科學科系之差異，在於聚焦於地表岩石風化層(土壤層)的研究; 與環境工程之差異，在於本系聚焦於如何解決農業生產所導致的環境問題或解決影響農業生產的環境因子; 與農業化學之差異，在於本系在農業剩餘副資材再利用及農場經營實務有更多著墨與學習機會。

與本系相關科系如食品科學系、水產食品科學系、食品營養學系、食品保健系等，在課程規劃上各有異同和重點，本系課程教學及研究則包含食品加工工程、保健營養與食品化學、食品微生物與生物技術等三大領域，本系開課數量及領域更為周延完整，提供學生更完整多元的學習。

除土壤環境之專業科目外，本系同學在化學及生物相關課程的訓練甚為紮實。每年大學畢業生近一半以上選擇進入國內著名研究所進修。本系畢業生除在大專院校任教及農業相關機構服務外，亦多跨足於環保、環檢、醫藥、奈米與生物技術及材料化工等領域。

本系學士班畢業生在生涯發展上目前大部分選擇繼續升學，證照考試上食品技師、乙丙級技術士為主。就業方面包含食品科技業、醫療保健、一般產業及公職等，發展方向多元，不單單侷限在傳統的食品加工產業。於升學發展上學生有多元的選擇，學生依個人之生涯規劃轉換領域進修生醫所、生物科技所、農化所等相關研究所。

過去高中生一聽到土壤二字，就聯想到當農夫從事農業的生產，本系的教學與研究雖然與土壤科學有關，但學習及研究的範疇已擴大到環境保育、奈米與生物技術的開發、毒物分析、水資源管理、土壤碳匯、與都市及農業廢棄資材的再利用等。

在本系課程規劃上涵蓋「食品加工工程、保健營養與食品化學、食品微生物與生物技術」三大領域，常有高中生誤以為課程著重食品加工或烘培等方面，其實本系大學部學生在學習上多元而廣泛，可提供後續生涯發展之多元選擇。

除了本系所開設之課程外，本系亦鼓勵學生透過教育部的補助計畫與本校姊妹校交流，或透過本系系友及教師的協助出國做短期學術交流活動或研習，以增廣學生的國際視野及提高學生的競爭力。本系亦設有出國研習的經費補助辦法，亦與美國德拉瓦大學環境工程系及猶他州立大學植物、土壤與氣候學系簽訂雙聯學位協議，目前已有2位雙聯博士學位畢業生。

本系教育目標為「培育食品科技及生物技術領域之實務人才」。並使學生具備「食品科技及生物技術領域之專業知識及技能、了解食品科技及生物技術領域之專業實務、培養食品科技及生物技術領域之全球化視野、培養邏輯思考、溝通協調能力及團隊合作精神」之核心能力。師資陣容上具備完善的師資陣容及教學設備，提供學生在各個食品科技領域上充實的知識及技能。