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慈濟大學醫學系的教育目的為培養術德兼修、關懷生命、擁有大愛與利他之情懷，善於溝通、重視團隊合作，樂於承擔社會責任，並具備主動及終身學習的能力，以奠定醫學生成為良醫之基礎。
教學特色：1.「無語良師」課程；2. 系統模組化教學； 3. 精緻的臨床技能中心；4. 跨院區整合之教學、研究；5.典範的床邊教學。

本系位於全國最卓越的綜合型大學醫學院中，有最優秀的師資提供多元化的學習課程及最精密的教學研究設備，同時擁有醫學中心及社區化的臨床實習機構，提供學生最優良的學習環境。
本系之教育目的：培育良醫、服務社會、領導醫界、貢獻⼈類。畢業生遍及本島及世界各大醫學中心，造就眾多國家級的一流學者、國內外無數的一流臨床醫師、傑出研究人才及醫學教育家，是國內最熱門的科系。

醫學系修業年限為六年，課程以四大架構規劃-1.醫預科階段：基礎科學的紮根；2.基礎醫學：以器官系統導向之模組，基礎醫學搭配臨床情境之介紹，以銜接臨床課程；3.臨床實習：一般醫學核心能力，增加病人照護學習；4.醫學人文：整合不同深度及內涵之醫學人文、倫理及溝通。

醫學系修業年限為六年，畢業後授予醫學士學位。
本系為進行有關醫學教育的應用科學學系，教導學生修習大學共同課程、通識課程、基礎醫學課程、臨床醫學課程，並提供完整的臨床各科部實習，以期學生畢業時能具有大學學生的基本知能及一定的診斷、治療和預防生理、心理疾病的專業能力。

強化基礎科學知識，訓練組織推理與多元思考能力，培養自主學習、主動積極的思維與態度，加強英語閱讀理解能力，嘗試同理他人心理，培養關懷尊重生命、成就大我的態度。

1.
經年累月的、心無旁鶩的持續閱讀
2.
身邊隨時會有好朋友可以和自己腦力激盪、互相討論、切磋
3.
學習彙整相關的知識、記憶，融會貫通
4.
知其然，更要知其所以然
5.
物有本末、事有始終，要能追根究柢，也要能觸類旁通

醫學系畢業生具有報考醫師執照國家考試資格，通過國家考試取得醫師資格後可從事醫療工作，實際執行醫療行為；醫學科學及生命科學相關科系則多以從事生物醫學相關研究工作為主。

醫學系的學習內容包括基礎科學及臨床醫學，學生畢業後可參加國家醫師考試，取得醫師證書。工作上有多元的專科選擇，例如內科、外科、婦產科、小兒科、急診科、各臨床科系等。

一般人可能認為醫學系畢業生只能擔任醫師的行業，其實不然，許多醫師也致力於教育，學術研究，生醫創新，甚至人道救援等面向，成為各領域之菁英；但是要擔任醫師，絕對需要就讀醫學系並順利畢業。

本系畢業生除畢業後經過多年住院醫師訓練成為主治醫師，肩負起照顧人們健康重任外，同時也可在醫學院擔任基礎或臨床的教師或研究員；未來也可投身進入公共衛生相關領域，成為政府衛生行政官員或大型醫院管理者；亦可進入目前最熱門的生物科技產業企業進行研發工作。

外界常以為一進入醫學系就讀，便需要選擇未來所要從事的醫療專科。實際不然，醫學系修業規劃為期6年，內容包含基礎醫學與臨床醫學相關知識與技能的學習，在實習階段，醫學生仍需經歷各主要臨床科別的學習，期間可以依興趣自選部份科別實習，畢業後也需接受包含各主要臨床科別畢業後一般醫學訓練後，才會決定執業專科領域。

1.
在學習內容上各科有其專業知識，一個症狀可能源自不同病因。
2.
本系採⽤器官系統整合教學授課⽅法，同時探討不同器官組織系統間彼此影響，與⼀般⼤學教學⽅法完全不同。另外由於科技的進步，需有主動學習的熱誠與時俱進。

慈濟大學醫學系雖為宗教團體支持所建立的大學，僅將宗教的濟世救人的情懷作為學習與涵養的內涵，因此入學與畢業門檻皆無宗教要求或限制，慈濟大學的眾多師長，包括前任校長，以及臨床醫師皆非佛教徒，慈濟大學為師生多元化的綜合大學。

無