本系學理與實作並重，教育目標在建構優質的學習環境，進行化學相關之創新研究與應用，以培養具有人類與社會關懷之化學科技人為最高教育理念。本系教學循序漸進的培養學生之基礎學科，包括有機化學、無機化學、物理化學、分析化學、生物化學及相關實驗課程。進階化學課程則以『生物材料』、『化學材料』、與『有機合成』之相關學科為核心課程，同時著重學生實務經驗之養成，使其具有生化及材料專長之高級化學人才為特色。

本系創立於民國44年，為創校四系之ㄧ，民國88年將化學系分成化學組及材料化學組，兩組各招收一班，並同時設有碩士班、博士班、碩士在職專班(碩專班)，經六十餘年不斷努力求新，已擁有一流的師資和設備。本系曾獲教育部全國大學--化學學門評鑑第九名，且是私立大學中排名第一。

本系名為「應用化學系」，除有機化學、無機化學、物理化學、分析化學等化學基本課程及相關實驗課程外，進階化學課程則以生物材料與化學材料之相關學科為核心課程。除了著重上述化學系所的專業基礎知識之傳授，更強調化學與產業的結合及應用。同時著重學生實務經驗之養成，使其具有實際解決問題的能力。

中原大學化學系，以分子的層級為原點，學習化學反應所牽涉的科學，教師研究方向包含，電池開發、生醫材料、高分子材料、新材料合成及特性研究、生物化學、藥物開發、環境保護、新分析方法開發、有機/無機合成及理論計算等。

本系重視「專題研究」，使學生具備化學實務、動手操作及解決問題的能力。規劃「產業化學」之課程，使學術與產業接軌，讓學生了解當前化學產業之發展趨勢。

多加觀察日常所接觸到的化學現象，並且關心時事中有關於化學的人事物，保持自己的好奇心。

本系發展重點包括醫療及農業用藥物合成、高分子及奈米材料合成、無機合成、化學生物分析及檢測、基因及蛋白質工程、環境污染防治、各種化學反應及其分析方法建立。應用化學系和化學系及化工系的差異在課程設計，化學系較偏重理論、基礎知識的養成及原子分子的反應與設計。化工系的訓練則強調化學工廠的生產與操作、物質的輸送與儀器設備的設計運作。應化系介於兩者之間，除基礎科目外，有多元化課程選修設計，強調跨領域應用。

化學系與化學工程系差異，化學系注重分子層級的設計與探討，發展理論並且應用於深層化學問題的解決，為各領域研發必要之科學、化學工程系注重生產所需的可行性，例如輸送，反應放熱之處理，偏重大量生產時應用科學的視角。

化學常被視為危險的行業，常與爆炸、強酸、廢水、製造環境污染聯想在一起，其實隨著技術不斷創新及環保意識的提昇，許多化學相關工業已逐漸轉型為綠色、節能、食品安全、奈米材料等高科技發展，出路很廣。

一般而言，多被認為化學系畢業多半擔任研發工程師而化學工程系則擔任製程工程師，事實上，化學乃所有技術製造業之基礎，擁有基礎後並能學以致用於許多行業上，例如：半導體產業、生技製藥產業、先進與傳統材料產業、電子與顯示器產業、食品產業、醫學、環境檢測業、專利師及化妝品產業等等。

1. 應用化學系和化學系及化工系的差異在課程設計，化學系較偏重理論、基礎知識的養成及原子分子的反應與設計。化工系的訓練則強調化學工廠的生產與操作、物質的輸送與儀器設備的設計運作。
2. 應化系開之藥物化學課程注重藥物結構，學習優化先導化合物為上市藥物，而藥學系之藥物化學，則較注重藥理機轉。

外界常誤解就讀化學系做實驗有危險性，相反的化學能更了解許多日常生活中化學物質的作用，進而避免或降低發生危險的可能性。再者本系有4位講師，專職大學部實驗課程，著重實驗教學品質及安全，目的是希望同學們養成謹慎的實驗習慣。

無

本系特色 :
(1)發展「新型奈米材料之研發」為本系研究特色領域
(2)整合教師研究專長，申請跨領域整合型計畫
(3)本系教師研究與學生專題實作課程及研究生化學技術課程結合。

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