本系以培育具跨域創新及專業能力的醫學工程專業人才為目標，為南台灣第一所生物醫學工程學系。因應國家政策未來趨勢及醫療器材產業發展之需求，規劃生醫電子暨醫學資訊、生醫材料暨組織工程、生物力學暨福祉科技特色領域課程，配合義大醫療財團法人之設備與臨床師資，訓練培育具有跨域整合創新能力之醫學工程專業人才，並規劃校外實習課程以提升學生就業競爭力。

以培養理論與實務並重之人才為目標，不僅著重化工基礎訓練，並包含生物技術、材料科技及清淨製程、綠能環保等方面的課程與研究。化工系畢業生就業市場廣泛、可進入藥廠、傳統產業、生技產業、晶圓產業、半導體產業、光電產業、環保及廢水處理、綠能等眾多產業，橫跨傳統、高科技及生醫產業，值得您的投入。本系教學加強實驗及操作課程，歡迎對實作、生產製程、研發有興趣者加入。

生物醫學工程學系是將工程領域的專業技術能力與臨床醫學需求做更密切的結合的學系。

化學工程是一門應用科學，課程多元性。皆本著理論與實用兼顧，授課與實驗並重為原則。本系規畫了 「生物科技」、「製程科技」及「材料科技」三大特色領域課程。單元操作與輸送現象、化學反應工程、材料科學、半導體製程、生物化學、生物技術概論、生醫材料、儀器分析、程序控制、分離技術等皆是結合產業相當重要的課程。

基於上述的學習方法，學生在「個人線上學習」方法上，要具備主動性，同學要養成線上觀看或是下載檔案進行非同步線上學習的習慣。在「小團體讀書會」方法上，學生要培養與同儕互動學習的能力，應具備主動分享與合作的習慣。在「補教教學」的方法上，同學要養成發問問題與整體問題的能力，上補教教學課程時，要養成敢問老師問題以及針對問題答案或是解題流程的整理與分析的能力。

化學工程師需具備化學、數學及物理的核心知識，以作為工程應用之基礎。除了學習理論基礎外，更需要深究其應用面，如何應用這個基礎知識在工程相關的設計與製程。因為化工的領域廣泛且內容豐富，需要具備歸納與融會貫通的能力，可以透過參加科學專題來加強這項能力，透過自己發現問題，嘗試解決回答它，將有助於提升自己的觀察力，歸納與融會貫通的能力，同時也能培養動手做的實力。此外，與國際接軌一直是做個工程科技人所需要具備的能力，能隨時吸收外來最新的工程科技的知識，也要培養善用網路搜尋及資料整合，並提升英文的聽說讀寫能力。

學生普遍都分不清生物醫學工程學系(簡稱醫工系)與生物科技學系(簡稱生科系)的差異。醫工系是將工程技術應用於醫學相關領域上，包括生醫電子與資訊、生醫材料與組織工程、生物力學與輔具科技……等直接或間接作用於有使用醫學診療設備需求的人；而生科系則是著重於較細微的層面，如基因、蛋白質、醣質、酵素與生化工程的應用與發展。

對基本化學工程原理有整體的瞭解，涵括質能均衡、熱力學，動量、熱量與質量傳送，化學動力學與反應工程，分離程序以及程序系統工程等。這些關於設廠、放大量製程與產品化生產的訓練，為化學系、材料系及其他工程科系沒有教授的專業領域，對於學生的專業技術養成與就業是相當有利的訓練。

本系畢業學生的出路主要從事醫療相關的工程事務。畢業生從事醫療器材產業、生技暨醫藥產業以及在醫院工作的比例約為2 : 1 : 1。醫學電子領域跟電子系、醫學資訊領域跟資工系、生醫材料領域跟材料系或生科系、生物力學跟機械系有共同相關的課程，本系所學偏向於應用在醫療相關的行業。

一般學生認為化工畢業都是從事危險的現場操作及到危險易爆炸的化工廠，或是從是黑心食品的化學添加劑研發。其實化工人是最強調環保與工業安全，擁有最完整的工業安全訓練及環境保護觀念。化工系與日常生活息息相關，學生畢業後適合在各產業進行發展。

高中生最容易將｢醫工系｣與｢生物科技系」混淆，看到生物醫學工程系系名中的”生物”就以為是生命科學領域的學系。其實本系是以工程理論和技術為基礎，以解決生物、醫學與醫療問題；學習內容包括醫學電子、醫學資訊、生物力學、生醫材料與基礎醫學方面的課程。

學生一般認為化工系的課程困難艱深、數學及物理相關課程不易研讀，化學分量佔的比例多。
大學部課程因應社會變遷，授課內容及教學方式已做改變，讓同學能從課程體驗產業界實際運作的情況。而本系開設生物技術領域的課程，提供對生物技術、製藥及生技產業有興趣的同學更多的學習機會。

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化工已進入高值化時代，生技與化工產品之創新將是時代潮流，本系不僅如此，我們也把企業產品化概念導入高年級教學課程中，我們請生技公司總經理協助，教導學生實際從原料，設計配方，成本管控，市場反應，專利保護等設計並產出實體產品，例如保養品，益生菌，製程規劃等，同時也聘請公司高階研發部經理及生產部廠長參與課程教學，並讓學生去參觀實廠。

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