本系發展特色條列如下:

　（一）著重「綠色科學」及「奈米科學」人才的培養。

　（二）與地方政府、學校、研究機構與產業界合作共同發展臺東。

　（三）傳承發展科學教育的使命，培養臺東科學教育人才。

　（四）加強學生基礎科學的涵養與實務課程，以強化就業競爭能力。

本系學士班以整合地球科學與生命科學領域為基礎，並以全球環境變遷議題發展為本校特色系所。課程設計兼具基礎理論與實務應用，學生可按其興趣及升學取向，繼續往全球環境變遷、地球科學及生命科學領域深造：亦可依興趣選修實務，往氣候變遷調適及環境教育等就業領域發展。另本系所為師資培育並行學系，每年可提供15名以上本系所學生優先選修師培課程，擴展學生畢業後升學或就業之路。

物理學是自然科學中最基礎的學科，化學和生物學等科學乃至工程學科如光電、材料、電機等都是建構於基礎物理之上，因此學習物理是相當聰明的選擇，本系應用物理組的畢業學生絕大多數都能進入國內外大學之理工、光電、電機及資訊研究所繼續深造，或至科技產業發揮所學，除了完滿個人成就，對社會與國家建設亦能做出重大貢獻。

本系以「地球科學」及「生命科學」為學術專業，另依興趣選修實務及師培課程，往「氣候變遷調適」及「環境教育」等跨領域學門發展。結合野外調查與應用科學方法(地科、生科、環境學門等等)來分析與解釋在環境中所觀察到的現象。
研究領域涵蓋環境變遷、災害評估、環境汙染、資源利用、與環境永續等等多面向議題。

參加科學營與科學競賽

學科內容豐富且具一定廣度，因為需要具備歸納與融會貫通的能力，可以透過參加科學專題來加強這項能力，透過自己發現問題，嘗試解決回答它，將有助於提升自己的觀察力，歸納與融會貫通的能力，同時也能培養動手做的實力，此外，與國際接軌一直是所需具備的能力，因此提升英文的聽說讀寫能力，以降低未來在面臨英文授課時的壓力。

應用科學系應用物理組更強調基礎物理與生活科學應用的結合，佐以綠色奈米科學，將物理學知識應用於工程學科，包含光電、電子、材料、化工、機械等，讓學生能夠適才適性發展出自己的專長與特色。
本校雖位處偏遠，但本系師資及學習資源並不亞於西部其他相關科系，學生就讀本校，劣勢亦可為優勢，於優美的圖書館與校園環境下，呼吸最乾淨的空氣，成就個人學習興趣與未來專業，是其他大學所沒有的優勢。
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依本系系名，即可知本系以跨領域之生物與地球科學為基礎，培養環境變遷所需之科學人才。課程設計上分「地球科學組」及「生命科學組」，兼備基礎科學及應用科學，學生可依其興趣及就學取向，或修習教育學程，與其他純學科方式不同，以擴展同學畢業後升學或就業之路。

高中生最容易誤解物理系畢業後找不到工作，事實上，目前科技職場主要人力皆為碩士學歷，僅有大學學歷已不符合職場需求，因此大學就讀基礎科系，強化自身基礎科學知識，研究所選擇工程學科才是最佳的選擇，物理為工程科學基礎，擁有充實的物理知識，才能應付工程相關研究所創新應變、解決困難的需求。
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誤解就業及升學不易。實際上具優異發展。
【師培】在校可爭取師培及公費生員額的機會。
【升學】國立研究所考取率高，具專業知識及解決問題的能力。
【就業】與產官學合作，依修課規劃考取專業證照與認證，進入屬意職場，如生技公司、天氣風險、環保顧問公司等，落實學用合一，是業界歡迎的社會新鮮人。

本系課程以物理學為基礎，延伸專業模組課程涵蓋光電、材料、電子、機械、地球科學等領域，讓學生有充分的機會可以選擇自己興趣學科學習，除了畢業後可以報考基礎科學與應用科學等工程類之研究所，也易於找到適合自己未來的工作方向。

一般同學看到系名會誤解本系生物地科都需要修習，其實整體課程分為「地球科學組」及「生命科學組」兩大領域喔。當然亦可跨領域將生物與地球科學作為基礎，培養環境變遷所需之科學人才；兼備基礎科學及應用科學，學生可依其興趣及就學取向，或修習教育學程，擴展學生畢業後升學或就業之路。
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本系分為[應用物理組]和[奈米科學及化學組]，修讀本系可以充分選修兩組間的所有課程，並且部分課程由化學及物理老師共同開課，學生可以很快培養個人對部分學科的興趣，並強化自己的學習目標
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本系學制除學士班外，另設置有碩士班及碩士在職專班。
本系環境教育與資源碩士班為國內少數專門培育環境教育專業人才的碩士班，同時與本系生物、地科領域扎實基礎學科知識相結合，同學可於大三下申請預研生資格，即可於大四併修碩一課程，考取本系研究所後即可以一年的時間獲得碩士學位。

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