海洋科學系為台灣頂尖研究型大學中唯一以海洋科學為教育目標的科系，全面整合研究教學資源，培育全國具最紮實海洋科學專業之學生，提供本校及國內外各機構發展海洋相關研究、產業、教育之所需的人才。本系著重全球性環礁生物多樣性、海洋碳循環、全球變遷研究等方面的研究，以為提供海洋環境保護、資源利用、以及海洋法規制定與管理之。

本系成立宗旨在造就建設與保護海洋環境所需的規劃、工程設計與管理方面人才，除積極研究海洋環境變遷、藍色能源、生態工程、人為汙染及其防治對策，同時亦探究發展海洋工程技術與資源有效利用的技術與制度，以永續利用自然資源、提昇環境品質。海工系為一整合性的新興學門，畢業後不論在進修或就業方面都極具發展潛力，尤其政府宣示海洋立國，前景無可限量。

海洋科學係研究海洋之學科，涵蓋海洋生物/生態、海洋化學、海洋地質、海洋物理等研究領域。海洋佔了地球表面超過70%，為了更瞭解這個美麗星球，我們以基礎科學為本，從海水與海洋的特性延伸，探討海洋中各種現象與原理，並從中學習如何維護海洋資源，以達到永續利用的願景。

本系課程就保護海洋環境所需的規劃設計與管理專業知識等各方面，做綜合性考量，包含一般工程學系所應具備之基礎力學與應用數學相關，同時著重海洋環境相關之基本原理及工程技術，結合海洋與近岸兩空間，就海洋環境管理體制、海洋工程技術、生態工程、海洋環境污染與防治、及海洋基礎科學如海洋物理與化學、海洋地形與地質、及海洋生態系統等，規劃整體性課程。

海洋科學是研究海域中，包括淺海及大洋，各種現象的成因及對世界的影響。這些現象常常不是單一因素所造成，它們的衝擊也非單一面向，因此海洋科學的關心的議題甚廣，從自然科學到人文社會科學，而研究方法涵括甚廣，生物、地質、物理及化學的基礎知識亦是必備的能力。

工程教育的最終目標在培養學生成為有能力發現問題，運用所學知識解決問題的人才，因此在修習各門基礎學科理論時，除了概念外，更應重視其應用面，如何應用具備之學理知識，解決實務上的問題。為因應科技日新月異知識爆炸的時代，建議學生除了訓練自己將學科內容歸納與融會貫通外，亦需具備主動學習、團隊合作等能力。此外，提升英文的聽說讀寫能力，可以拓展學習涉略範圍，接軌國際開闊視野，大幅增加學習效果，對學生未來職涯發展更有所助益。

海洋科學系重視基礎海洋科學的建立，包括海洋生物及生態、海洋化學、海洋地質、海洋物理四個領域。
海資系：以海洋生物科技與海洋資源為重心。
海工系：以海洋環境及海洋工程為重心。

本系為整合性之學系，包含水利工程、土木工程、環境工程、生態工程等相關領域，亦涵蓋海洋科學及海岸工程學，因此與上述系所有所不同。

1. 海科系畢業只能繼續作海洋相關研究。
2. 海科系畢業生就業統計：私人企業單位含工程顧問公司、科學園區、環境影響評估、生態旅遊、水產飼料養殖；公立海洋相關機構及教育單位、研究單位、政府機關。

許多同學以為本系畢業生只能待在海上，其實不然，本系所學領域甚廣，含水利、土木、環工、海洋，所以畢業生的出路廣泛，可從事例如海岸工程、海事工程、離岸風電等產官學研工作。

學生不太清楚海洋科學系在學什麼，其實海科系很重視學生基礎科學的能力，所有海洋學課程理論皆建構自基礎科學，學生可依自身興趣選修海洋生物、海洋化學、海洋地質、海洋物理四個領域中的課，具備跨領域的能力未來在求職方面將具有極大優勢。

許多高中生認為本系是否要出海捕魚？
本系開設一門必修課為海上實習，提供學生於海上作業的觀摩與實作機會，使學生了解海上觀測作業的流程以及必備的知識。並非一直要出海，也並非捕魚。
本系非傳統環工系，為整合性之學系，包含水利工程、土木工程、環境工程、生態工程等相關領域，亦涵蓋海洋科學及海岸工程學。

本系畢業生就業領域相當多元，除繼續深造外，私人企業單位如工程顧問公司、科學園區、環境影響評估、生態旅遊、資訊、貿易、水產飼料養殖等，而公立海洋相關機構，含國中小、高中等教育單位、各大學、中研院等研究單位、政府機關、氣象局、中油、地調所、水試所等，端看學生主修領域，學生入學後可慢慢探索興趣及未來志向！

本系具備海洋工程、土木工程、環境工程、生態工程等綜合專長，因此本系畢業生有眾多職涯選擇，除可選擇已日漸成熟之離岸風電相關產業，如海事工程、水下探測、港灣工程建設等，也可回歸傳統陸地的土木營造、環工、水利等就業市場，可謂海陸通吃，大大擴充職涯發展可能性，此外本系授予工學士，故也可往高科技電子、光電產業發展。與本系相關之就業單位有政府機關、研究機構、民間企業、專業技師等。

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