以培育學生成為水產養殖與生物科技之專門技術與研發人才為目標。大學部以基礎養成教育與專業訓練為二大主軸，分為養殖與環境、水產生物、營養飼料、病理與免疫、管理與系統分析及分子生物技術等六大專業學門領域，完整涵蓋水產養殖產業之所有專業技術。另配合六大學門教學開設相關實驗教學課程，並於本系附屬「水生動物實驗中心」提供學生極佳之實務操作學習空間，培養學生成為學理及實務兼俱之水產養殖專業人才。

本系為全國最大的動物相關科系，有優質的師資陣容，規劃有動物科技、生物技術、保健產品三項專業學程供同學選讀，另有碩、博士班，升學管道暢通。設有實驗動物中心、五結實習牧場、生技保健產品試量產工廠，提供豐富且多元的教學與研究環境，同學大三開始必須修讀專題研究，教師研發能量全校第一，與產業界合作緊密。

水產養殖學科定義：指利用水域，人工養殖各種有經濟價值的水生動植物以取得水產品；是廣義農業的重要組成部分，也是漁業（按生產特徵即分為養殖業和捕撈業）重要的類別之一。

生物技術與動物科學系學習範疇相對廣闊，包含生物技術領域（生物化學、生物技術學、分子生物學、遺傳工程技術等）及動物科學領域（動物繁殖學、動物育種學、動物經營管理學等），並結合兩者長處，整合出保健產品領域（塑身生理學、機能性營養生化學、保健食品等）。

建議可於高中階段多加強英文、生物與化學學科之學習外，課後可多關注與養殖、生技產業之相關議題及報導，透過前往水族館或養殖等相關場域來瞭解自己的興趣方向。本系係屬於理論與實務相互應用的科系，需要做中學，所以需要保有對生物的熱情及實務操作的積極度，且需要具備觀察力、發現問題及解決問題的能力，可透過參加科學專題來加強這些能力。

準備特殊選才入學同學可嘗試針對一主題深入探討，嘗試動手操作，並整理紀錄，準備繁星入學及考試分發同學請加強學科能力，準備申請入學可加強書審資料分類整理。

水產養殖學系簡稱為養殖系，教育目標相當明確，歸屬於「生物資源」學群，「海洋資源」學類；相較於其他生物資源學群之相關科系，本系學習的領域著重在水生生物及養殖相關領域，更具備專業性，具論理與實務合一之海洋特色學系，且其所學能實際應用於水產養殖或生物科技相關產業。

生物技術與動物科學系之生物技術部分較易與生命科學系混淆。以科系分類上來看，生命科學系多源自於較早的生物系，或是動物系與植物系的合併；而生物技術系，除了單純的生物技術學系，也常見與原本的生物相關科系研究專長結合，如本系：生物技術與動物科學系，就是原先的動物科技學系與生物技術研究所，相互擷取其研究專長及特色而合併而來的科系，顧名思義就是將生物技術應用在動物科學的研究上，以取得最大的教學及研究效益。

出路包括：現場養殖、水族公司、海洋博物館、飼料研發、水產品檢驗或行銷、生物技術相關產業等；也可往相關公部門（如：農委會、漁業署、水試所、各縣市政府漁業課、各區漁會）或相關教育或研究機構發展。具高度專業性且又可跨足其他生物領域，出路甚廣。

本系同學畢業後可報考畜牧技師，然而，非獸醫學系畢業的人無法取得獸醫師執照，所以本系大學畢業生不能成為獸醫師。但若是想在動物相關領域發展，本系非常適合喜歡照顧、飼養動物的同學選讀。

水產養殖課程涵蓋了養殖與環境、水產生物、營養飼料、病理與免疫、管理與系統分析及分子生物技術等六大專業課程，是一門相當專業與廣泛的農業相關技術學門，且理論與實務並行；除需具備許多的專業知能及實務經驗外，也逐漸導向智慧農業方向發展，已與傳統養殖產業僅透過經驗傳承方式截然不同。

本系專業必修就有61學分，另外在專業選修學分內規劃動物科技、生物技術、保健產品三項專業學分學程，同學必須於畢業前依自己本身專長及興趣完成至少一項專業學分學程，並非只能限於某一領域選修。同學有時間、有能力，皆能為自己量身打造想要的學習菜單。

建議高中生可以從學系專任師資專長協助瞭解學系。

本校五結校區畜牧場已完工，內部設備新穎完善，工作人員及動物已開始按計畫進駐，將可提升本系動物科學之教學研究及學生實習能量。

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