商船學系為高教體系全國唯一培育船副、船長等航海專業人才的科系，亦培育船務與港務管理方面之海運相關人才。課程規劃為航行與船務等兩大專業領域。以永續發展的商船專業知識並與國際海事組織接軌為培育海事專業人才為宗旨。課程規劃為航行與船務等兩大專業領域，就業發展領域主要為航業界、交通航政機構、船務代理業與各級海事教育研究機構等。

淡江大學運輸管理學系為一跨學域科際整合學系，以培養公/鐵路、海/空運、都市運輸各方面專業科技與管理人才為目標。本系為全國唯一位於大臺北都會區的交通運輸科系，產學合作資源豐富。師資專長領域涵蓋智慧運輸、大眾運輸、物流供應鏈、交通工程與控制、運輸經營管理、運輸安全與人文/環境。課程結構完整、理論與實務並重，設有物流管理與空運管理學分學程，及運輸科學碩士班，提供全方位學習地圖與職涯發展。

商船學系是以航行與船務等兩大專業領域作為課程之規劃，藉由船舶管理及航行的學科知識，並運用實務模擬課程之連結，以永續傳承海事相關專業知識為培育與國際海事組織接軌海事專業人才。

本系系名所指涉的學科係涵蓋所有與運輸系統有關的管理領域學科，屬於跨學域科際整合學科，包括商管領域學科及所有與「運輸」相關專業知識，涵蓋運輸系統基礎理論、工程、規劃與管理學科，包含鐵、公路、軌道、海運、航空、物流、觀光旅遊等營運管理，及智慧運輸、資通訊科技、與人文社會、環境議題。

培養自我學習能力，加深加廣修習語文、數學及自然科學之領域等相關課程，且積極參與資訊、工程及數理化等自然科學領域之相關課外活動、研習或競賽，養成主動探究與問題解決的能力。


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團隊合作、分析及解決問題、執行活動的能力。

本學系教學與研究之內容以海洋運輸、航海科學與海事管理之專業領域為主，課程設計包括：航海科技、航行安全、海事保全、船務管理、港務管理、海事政策、實習訓練等相關海上實務課程。
1.輪機系：係以船舶機械、動力及電機等工程為學習重心
2.航管系：係以航運經營、管理及航務行政等為學習重心

本系與其他物流、行銷流通、航運管理及其他管理相關科系的異同：本系領域範圍更廣，課程也包含商管核心課程、物流供應鏈管理、行銷流通、航運管理外，更涵蓋都市運輸、公路、鐵路、海運、航空、智慧運輸、大數據、資通訊各方面運輸專業科技與管理，本系亦設有跨院系之「物流管理」與「空運管理」學分學程作為整合學習。使本系畢業出路可往政府機關、公民營運輸事業、物流、行銷流通業外，亦可往一般企業發展。

要上船工作就要唸商船系，這句話是對也是不對。唸商船系是踏進航海工作的捷徑，但就業的出路卻不是僅只於航海，而是猶如大海般的寬廣。例如交通部港務局、台灣港務公司、海事研究從業人員、海事、船務、航運相關企業。

本系畢業出路最常被誤解為僅從事運輸服務人員 (如：司機員、物流人員、空服員、交通指揮…)，實際上，本系畢業生出路非常廣，可任政府機關公職、國營事業、公民營交通運輸業、顧問公司或一般企業，擔任中高階主管、運輸專業人員、規劃、科技與管理人員。

本系課程，除基礎的理科科目，專業必修對學生來說都是新的，所以都要去學著適應。雖然有些實作課程很有趣，但必須說，商船系的學科絕大部分都強調背誦。對一類組的同學來說，微積分、工數、力學等會很頭痛；而二、三類組會覺得其他要背誦的專業科目很麻煩。

交通運輸因與民生息息相關，最常被誤解就是到底交通運輸要學什麼。其實，運輸是非常複雜的系統與問題，學習運輸主體、時空特性、如何完善有效率運作與管理。課程重視邏輯思考、數量方法、統計數據分析、規劃與問題求解、資訊應用能力。

學生可依個人職涯規劃選擇航行或船務為主修領域，以為將來就業出路，另可修習他系輔系、雙主修學程，結合本系特色課程，發展個人於海事獨特領域之就業競爭力。

本系課程地圖特別依照學生職涯發展方向(公職或國營事業發展、學術研究、交通運輸業或一般企業)連結課程關聯之學習路徑，選擇專業課程修習，並規劃有「物流管理」與「空運管理」學分學程提供跨院系整合修習。
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