1.以「企業導向」為人才培育重點。
2.以食品科學與生物技術為主軸，持續進行新課程、新技術與新產品之研發。
3.與食品、生技業界合作，共同培育食品生技專業人才，結合專業理論與實務，對焦產業人才需求。
4.擁有完備的教學空間與先進的儀器設備，以「做中學」、「學中做」的教學理念，鼓勵學生「動手做」，連續多年於全國食品創新創意競賽獲獎。

本系教學著重培養食品工業技術人才，期能擔負食品之加工、製造、分析、檢驗、管理和生產等任務。本系也以「培養五育均衡發展、理論與實務兼具之國際化專業人才」具有高度關聯性，且呼應理工學院的教育目標「培養具備基礎科學知識以及專業技能，同時尊重多元文化及兼具國際視野之優秀人才」為教育目標與學校教育目標。

「食品科學」與「生物技術」是跨領域的應用科學。我們主要研究的對象「食品」，特別是研究食品的理化性質、食品的劣變因素、食品加工與保存技術、食品分析檢驗技術、新穎性產品的開發、生物技術的應用。簡單的說，本系的研究主題就是在科學與技術的基礎下，如何讓人吃得安全、吃得美味、吃得健康。

食品科學系的教育目標
1.訓練可應用原物料及生物資源的調查能力。
2.培養食品科學相關技術。
3.培育食品經營管理者的專業知識。
4.養成多元與持續的學習熱忱，正確的工作倫理及責任感。

除了基礎的原理外，需要更深究其應用，本系學科內容豐富且具一定廣度，因此需要具備理解、歸納與融會貫通的能力，可以透過參加專題研究來加強能力，透過發現問題、解決問題的過程，同時也能培養動手做的實力。

在閱讀各個基礎學科與知識時，除了基礎的原理外，需要更深究其應用面，如何應用這個基礎知識在製程與應用上，此外，因為學科內容豐富且具一定廣度，因為需要具備歸納與融會貫通的能力，可以透過參加自然科學專題來加強這項能力，透過自己發現問題，嘗試解決回答它，將有助於提升自己的觀察力，歸納與融會貫通的能力，同時也能培養實作的實力。

其實「食品科學」與「營養科學」兩個領域關係密切，本系以「食品科學」與「營養科學」兩個專業共同發展為特色，分為「食品與生物技術組」與「營養與保健組」，分組不分系，且跨組開課，使得本系的學生將有更多跨域發展的機會。
目前，多數學校都是單獨成立「食品科學系」或單獨成立「營養科學系」，使得兩個領域的老師與學生缺少對話、合作的機會。另外，本系與其他餐飲相關科系不同，餐飲相關科系的學習著重於廚藝、料理。

本系也針對地方傳承永續發展且創造產業特色，以下列三項目標培育人才。
(一) 針對金門農業特產，培育農產品加工，生產之人才。
(二) 配合地區特色，培養酒類釀造，生產和分析之人才。
(三) 配合國家發展計劃，培養發酵技術人才。

本系學生畢業後可以考取國家食品技師證照。畢業後可在食品產業、保健食品產業、生技產業擔任生產製程工程師、分析檢驗師、品保工程師、產品研發工程師、行銷業務經理、經營管理人員等職務。

畢業生出路有食品產業相關專業人員例如研發,品管及衛生管理人員,不是廚師或烘焙師但是若有興趣也可往此發展,但本系的授課主要是培育食品科學的專業知識,而不是廚藝及烘焙訓練為主。

本系學習的內容主要為食品加工保存、安全衛生、營養健康，畢業學生可以考取國家食品技師證照。本系與其他餐飲相關科系不同，餐飲相關科系的學習著重於廚藝、料理。

食品科學系常被誤解為烘焙或餐飲,食品科學系強調以科學的方法,解決食品領域所面臨的問題與困境,開發新產品,提供新技術。

本系之部分課程已逐漸採取創新之教學方式，例如大三「食品設計與開發」課程，將「創新創業教學」融入課程，並以「體驗式學習」的概念，進行活動設計、情境模擬與場域安排，強調做中學，讓同學實際經歷完整的「新產品開發」的過程。
因此，本系特別歡迎喜歡動手做、動腦思考的同學加入我們的行列。

食品加工、食品衛生安全、新產品開發及食品分析等為本系學科的重點。

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