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本系為國內第一所私立大學音樂系，民國52年日間部開始招生，民國98年更名為「音樂學系」，並成立音樂研究所，邁向系所合一之發展。本系有五年一貫制，大三生通過審核，得以在大四先修習碩士班課程，優秀者可五年拿到本系碩士學位。
學士班因有Ｂ組（不須術科考試）入學，而有商業音樂編曲、演奏（唱）之主修及相關課程之修習，有別於其他音樂學系。

『國立清華大學藝術學院音樂學系』，多年來音樂學系在音樂藝術領域中持續追求專業卓越，除課程設計豐富多元，紮實創新之外，亦著重跨領域合作，朔造美學素養，拓展學生豐富的音樂藝術表演舞台。在國際視野上，本系積極開拓國際學術交流，邀請國際知名音樂家到校演出暨大師班指導，提供國際交換學生的甄選機會，使音樂專業能力提升至全球化、現代化的藝術水平。

本系以學習西洋古典音樂為主，設有教研室—鋼琴組、弦樂組、管樂擊樂組、聲樂組、理論作曲組，各組皆由一位專任教師擔任召集人。民國105學年起設立商業音樂組(111年改稱為應用音樂組)，培養符合現代社會潮流下所需之音樂專業人才。

音樂學系學生依主修樂器之不同，系所為其規劃紮實多元、開放的課程(含所需的必修及必選學分)、及跨領域課程，以及增加音樂專業及產學合作所需之相關課程，如劇場排練實務、鋼琴調音及基本維修、編創劇場、跨領域表演技巧、音樂與劇場創意製作專題、多媒體與音樂創作等課程，也在學期間開設工作坊，內容包含聲樂家的嗓音保健及聲帶保養、表演藝術傷害之預防與治療。

主修部分需要每天固定練習，基本功很重要，可以多聆聽現場音樂會或大師演出、接受或旁聽大師指導。
除了主修外，可以多涉獵音樂領域相關資訊、演講或書籍，增進廣度與深度。

本系目前已建立與市場、生活連結的課程學習，如音樂治療理論與實務 -協助建立桃竹苗醫療體系合作網；鋼琴教學與經營實務 -與新竹地區音樂教育機構及小學等均實質的培訓計劃與成果；劇場排演實務 -與線上劇場導演、舞台燈光技術指導、服裝設計師等跨領域合作。未來將以新竹地區清華理工資源為基底，結合音樂與科技跨領域的實驗課程，期許在創作表現上建立特色指標。本系亦持續規劃『藝術走入社區、音樂生活化』之展演與講座，以清華為後盾，注入資源，強化國際音樂交流，增加國際級音樂家駐校計畫及國際交換學生數量、簽訂國際發展音樂產學合作模式，全面開發本系師生國際音樂表演平台。

位於風景優美的陽明山半山腰，亦為國內系所最多的綜合大學，擁有最豐富的多領域教學資源。
為國內第一個開放不須考術科可入學的音樂系(發分入學B組)。
為國內第一所開設應用音樂組的大專院校音樂學系。
唯一大一、大二主修個別課為一堂1.5小時，厚植同學專業樂器演奏能力。
擁有國內最早成立的巴洛克樂團及最完整的原樣巴洛克樂器。

音樂學系學生入學後，依照各自樂器大致可分為「理論作曲組」、「鋼琴組」、「聲樂組」、「管樂組」、「弦樂組」、「擊樂組」…等，學生可依據入學考試時已學之樂器作為分類，修習課程及其相關資訊可參考音樂系所相關簡介。

音樂系畢業後，不會僅限於只能當老師，本系的畢業生，除了教學工作(在國中、國小擔任教師、個人工作室、音樂教室)之外，還有從事音樂編曲工作、樂團團員、歌手、藝術行政等工作。建議學生在校四年，可以多方學習，培養能力，為未來生涯發展預做準備。

音樂系不是只有以舞台表演為唯一目的，而是培養“能運用音樂作廣泛發展及延伸”的能力。現今社會需要的是更多元化以及更富於創新之音樂人才，除結合其他藝術領域，如：古典流行爵士音樂、美術繪畫、科技光影…等，音樂系之學生更需要擁有想法和創意，於古典音樂之基礎下創造更新之音樂藝術展現與相關作品。

音樂學系不是只有學習主修樂器項目，還有專業理論方面的課程需要學習，如和聲學、西洋音樂史、曲式及分析、對位法等。尤其現在多元社會，學生的學習面向應該要更多元更廣，不只局限於音樂方面，除了專業方面的學習，還會有跨領域課程需要修習。

無。

無

音樂學系學生在專業技能精進過程中，也能夠在其他領域有相對的知識補給，以擴展學生廣域的性向發展與競爭能力，期待多領域的實質培訓能為多元藝術市場注入更多具創造力的優秀青年，讓學生學習全面國際化，系所相關資訊皆已公布於音樂系網站，並於每學年度皆有招生簡章，可於系網站搜尋相關資訊及報名表，或者來電(分機73104)洽詢相關問題。