公共衛生學院大一不分系採「大一不分系、大二分流」的方式。
學生大一修習相同必修課，大二再依個人興趣及專業科目成績依序選填志願進入本院所屬之公共衛生學系或醫務管理學系或職業安全與衛生學系，學生畢業時取得該學系之學士學位。
「延後分流」的設計，可以讓學生更加了解自我興趣及方向，入學後再選填學系時，可有更適合的選擇。
各學系之特色簡介如附檔。

1.師資完備，涵蓋公衛師所需五大領域。
2.資源充足，提供多元學習：輔系、雙主修、證照課程。
3.海外交換學生機會。
4.與英國Middlesex University簽有雙聯學位，大學四年可取得慈大與英國雙公衛學士。另也與美國Andrews University簽有MBA雙聯學位，碩士兩年可取得慈大公衛碩士與美國MBA學位。
5.設立學碩士一貫的實施辦法，五年同時取得公衛學士與碩士學位。

公衛系：主要培養生物統計、流行病學、環境衛生、衛生政策與管理學實務工作之專業能力。
醫管系：醫務管理為應用企業管理、醫療政策、基礎醫學專業於醫療照護產業。
職安系：為防止職業災害，保障工作者安全及健康。
詳細如附檔

1.公共衛生教育目的是期許學生具備評估、發展與執行改善方案的能力，並能有效地動員資源。
2.公共衛生五大專業領域為環境與職業衛生、流行病學、生物統計、衛生行政與管理及社會行為科學，本系課程設計強調五域並重，師資充沛足以支援各領域教學及帶領學生進行跨領域合作。

因應防疫、預防醫學、健康促進、環保以及長期照護管理等各方面的需求，公共衛生專業進一步精進，學生可多關心與公共衛生、醫務管理、職業安全與衛生學系相關訊息及活動。並充分了解自身興趣。

1. 多元學習，撰寫小論文。
2. 參加CPR訓練、救護志工等。
３. 多了解公共衛生相關新聞、報章雜誌或網站訊息。
4. 嘗試觀察一個疾病傳播、流行病學的的過程。
5. 參與校內外公共事務：校內公共事務，譬如班級事務、社團活動或校內學生會，學習領導、組織、規劃一項活動事務；校外公共事務可以利用寒暑假參加政府衛生機構或各大學辦理的健康服務相關營隊，在過程中不斷檢討改善，以利活動事務進行並達成最大目標。
6. 擔任志工。
8. 瞭解相關公共衛生機構：可以查詢衛生福利部以及其下各署、勞動部、WHO、各種衛生相關NGO機構等機構。

公衛系：污染物傳輸模擬及暴露評估課程，透過傳輸模式的實際模擬，培養學生面對環境污染衍生的健康風險之評估能力。
醫管系：企業管理為商業管理通才教育，醫務管理為運用管理方法於醫療產業之專業訓練，能瞭解管理與醫療。
職安系：職業安全衛生為專業主軸，重視通識、基礎以及安全衛生專業技術之全人教育。
詳如附檔
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1.師資完備，涵蓋公衛師所需五大領域，專業領域包含衛生行政與管理、社會行為科學、流行病學、生物統計學、環境職業衛生。
2.提供學生方案規劃、推動或評估訓練，包含衛生計畫與評估、健康促進規劃、疾病因子探討、處理健康資料數據能力、暴露評估。
3.見習加實習訓練，理論與實務結合，符合公衛師證照要求。

公衛系：除了公務人員外，另可擔任環職衛領域的專業人員、統計諮詢的顧問等工作。
醫管系：可能誤解醫管是管醫師或做掛號批價工作，其實是動腦筋的智囊團。
職安系：就業領域涵蓋政府職業安衛機關、科技業安衛部門、營造業勞安、營造業工安、醫療院所職安、職業衛生技師、工業安全技師等出路。
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公共衛生的工作出路包含衛生福利部、CDC疾病管制署、藥廠/CRO生物統計師、生統諮詢人員、統計分析師、程式設計師、環安工程師、非政府組織（NGO）、醫院管理、長照健康產業及學術研究。亦有眾多證照可考取，例如：公共衛生師、職業安全衛生管理員、職業衛生管理師、高普考 。

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公衛系：服務學習課程，主要至偏遠社區訪查，深入了解公共衛生議題，省思所學之價值。
醫管系：醫管系學習管理方法，以提昇醫療品質、控制成本，協助醫院永續經營。
職安系：對職安系認為與工地安衛管理等刻板印象，甚至認為女生不適合念職安系為錯誤觀念。學習領域涵蓋衛生、安全、工業管理、環境、共通之領域等課程。
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可能誤解為不知公共衛生就業市場在哪?其實公衛就業市場廣泛，包含
1.藥廠/CRO生物統計師、生統諮詢人員、統計分析師、程式設計師。
2.衛生福利部及其轄下部門(如疾病管制署、中央健保署)、行政院環境部及其轄下部門、各縣市衛生局、及各縣市環保局。
3.公共衛生師/職業衛生管理師
4.照顧服務員

公衛系：具備大學、碩士及博士班完整專業教育之學制。鼓勵學生參與國際衛生志工服務、推動與國外姐妹校簽訂雙聯學位等。
醫管系：醫管就業職場包括醫療事務室、管理中心、企劃室、品管中心、人事室、總務室、公關室、財務室等。
職安系：就業領域涵蓋政府職業安衛機關、科技業安衛部門、營造業勞安、營造業工安、醫療院所職安、職業衛生技師、工業安全技師等出路。
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1.本系畢業生研究所升學率成果優異，應屆畢業生考上公私立大學研究所比例約達三分之一，其中不乏為台大、成大等頂尖國立大學研究所。
2.本校就業率居全國私立大學前茅，本系因重視學生與實習單位之交流，學生在畢業前已具備公衛各領域基本知識與技能，深獲佳評。
3.台灣於2020年5月15日首度通過公共衛生師法，本系系友張維娟為2021年獲得首屆公衛師證照。

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