當今生命科學的重要使命之一乃為解決生態環境因我們人類破壞干擾所面臨的問題，本系自創系以來，即著重台灣本土生物與生態保育之教學與研究，致力於基礎生物與生態環境之資料調查與分析。教師的研究對象如哺乳類、兩棲爬蟲類、魚類生理、螃蟹、蜘蛛與昆蟲、藻類、珊瑚礁生態與魚類、植物生態與生理、森林動態研究等，近年來更從DNA分子延伸至生態系的整合教學與研究，為國內生命科學領域最完整的學習環境。

本系教學品質優良，在生態相關學系中，排名名列前茅，是國立大學中唯一以生態為名的科系。在生態學系中，本系課程的多樣性最高，包含生態保育、生態旅遊、環境科學、環境教育及環境永續等課程，因此，畢業生的就業選擇最廣和就業機會最多。本系擁有優秀的師資，有完善的研究設備，研究成果在國內外皆受肯定，系友表現受學界與產業界倚重。

利用分子生物學、演化學、田野技術、統計學等研究方法和知識，探究基因、生物物種和生態系统的多樣性，及其與環境的互動狀況，拓展生命科學與生態學知識的疆域，以保育生物多樣性與生態環境。

生態暨環境資源學系為跨社會與自然領域的科系，以生態學和環境科學的角度來探討生態環境議題及環境變遷問題，並謀求解決之道，以守護地球生態系。生態學為探討生物與生物及生物與環境之間的關係的學門。環境科學為跨學科領域的學門，目標在解決環境生態永續的問題。為尋求人類社會與地球環境共同永續，需要使用社會科學、自然科學與藝術人文等概念與技能。

進行與生態相關的學習活動，例如：賞鳥、進行生物觀察等

建議高中生關注環境生態永續及保育的新聞，增強生態、環境與永續發展基本概念。
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本系培養學生對自然與城鄉生態與環境棲息生物之專業知識暨調查研究技術能力，得以投入生態學相關之保育、農、醫、法、教學、研究發展等之產、官、學工作。有系統地教導學生實驗室與上山、下海等各種田野專業技能，具備在校內外產、官、學機構豐富的實習系統。本系研習生態演化及自然環境及野生動植物；有別於生醫科系宥於模式生物及醫學相關專業訓練，環工系著重非生物環境之診斷與修復，畜產系訓練對家禽家畜經濟性利用。

本系與生命科學和生物科技學系不同，也與環境工程和環境管理學系不同。
本系為跨領域科系，強調生態及環境資源的永續利用與保育。
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網路流傳「一日生科，終生科科」是最大的誤解，社會需要許多生命科學背景人才，出路很廣。相較於各校院諸多的生物科技系，生態組獨具特色，使畢業生能適性就業，就業率高，在政府相關部門，如農委會、林務局、特有生物中心、動物園、科博館、國家公園；私人企業如環評顧問公司、生態解說教育、環境友善農業，及跨域工作者。
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本系就業不只政府公職，也包括生態顧問公司，目前人才需求眾多。
畢業生也可以在非營利團體就職，這些單位通常能培育出傑出的社會實踐人員。
本系每年有5位國小師資培育生名額；不定時有在校公費生名額。

生態學不僅學習生物資源調查和標本採集工作，近年生態學使用的工具與分析方法有大幅進展，如遙測與地理資訊、DNA條碼、數學模型、基因體之大數據分析、無線電追踪、無人機調查、高速攝影、X光繞射等，探討問題也不斷創新，涵蓋遺傳、演化、物種、生態系、地景、一直到整個生物圈的多樣性維持與對人類生活之影響評估。

本系一般生物資源與生態演化系組不同，因為本系發展方向包括生態科學與保育、環境復育及環境教育，規劃有生態保育、環境復育、環境教育及生態旅遊課程，課程訓練內容較為廣及完整。

本系生態組強調將課堂知識與生活自然結合。專題課程讓學生進入老師研究室，與師長、同儕互動，進行兩年專題研究，將科學研究步驟觀察、問題、假設和驗證，落實並應用於臺灣各地與海外生態系研究，如金門、墾丁等陸域生態系和東沙、綠島等海域生態系，過程培養獨立思考與解決問題能力。

本系教育培訓內容包括生態科學與保育、環境復育、環境教育、生態旅遊及環境永續，比一般生態演化系、生物資源系及森林系更為廣，因此，就業的選擇更多。

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