當今生命科學的重要使命之一乃為解決生態環境因我們人類破壞干擾所面臨的問題，本系自創系以來，即著重台灣本土生物與生態保育之教學與研究，致力於基礎生物與生態環境之資料調查與分析。教師的研究對象如哺乳類、兩棲爬蟲類、魚類生理、螃蟹、蜘蛛與昆蟲、藻類、珊瑚礁生態與魚類、植物生態與生理、森林動態研究等，近年來更從DNA分子延伸至生態系的整合教學與研究，為國內生命科學領域最完整的學習環境。

以培育環境生物、漁業技術、漁場生態、海洋環境保護、漁業資源保育與復育、環境生物評估與管理等領域之人才為宗旨；在大學部著重於環境生物與漁業科學之基礎養成專業知識教育、教導漁業資源、海洋生物生產及漁業資源管理等，在學期間需進行4-8週海上或陸上實習訓練，結合學用合一。

利用分子生物學、演化學、田野技術、統計學等研究方法和知識，探究基因、生物物種和生態系统的多樣性，及其與環境的互動狀況，拓展生命科學與生態學知識的疆域，以保育生物多樣性與生態環境。

為我國整合海洋漁業及環境生物教育研究之最高學府，「以海洋漁業為主，但不以海洋漁業為限」的思維培育新世代漁業科學與生態環境領域「教學」、「研究」、「企劃」、「管理」之專材。其方向包含「環境生物」與「漁業科學」兩大主軸，包括漁業技術、漁場環境、海洋生態、漁業資源保育與管理等領域之學科訓練，蓄積進階知識。

進行與生態相關的學習活動，例如：賞鳥、進行生物觀察等

◆環境生物與漁業科學系： 要注意國際漁業動態、漁政機關政令宣導與時事，尤其需要勇於嘗試及接觸不同人事物,拓展生活圈了解基層第一線的需求、生活、工作模式,互助合作參加研究計畫訓練團隊研究力。

本系培養學生對自然與城鄉生態與環境棲息生物之專業知識暨調查研究技術能力，得以投入生態學相關之保育、農、醫、法、教學、研究發展等之產、官、學工作。有系統地教導學生實驗室與上山、下海等各種田野專業技能，具備在校內外產、官、學機構豐富的實習系統。本系研習生態演化及自然環境及野生動植物；有別於生醫科系宥於模式生物及醫學相關專業訓練，環工系著重非生物環境之診斷與修復，畜產系訓練對家禽家畜經濟性利用。

以發展「海洋漁業產業」、維護「海洋生態環境」以及健全「海洋資源管理」之教育研究理念，並以永續漁業經營發展為目標培育漁業與保育相關領域教學、研究、企劃及管理之專業人才。
水產養殖學系：以培養水產養殖科技人才，提升國內水產養殖技術與學術水準，發展水產增殖及生物科技為目標。
海洋環境資訊系：以培育海洋非生物科學、環境監測、資訊處理的科技人才為目標。

網路流傳「一日生科，終生科科」是最大的誤解，社會需要許多生命科學背景人才，出路很廣。相較於各校院諸多的生物科技系，生態組獨具特色，使畢業生能適性就業，就業率高，在政府相關部門，如農委會、林務局、特有生物中心、動物園、科博館、國家公園；私人企業如環評顧問公司、生態解說教育、環境友善農業，及跨域工作者。
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本系之教育目標與宗旨在於培育漁業科學與生態環境領域「教學」、「研究」、「企劃」、「管理」之專業人材。過去外界長期誤解本系畢業生之就業出路在於擔任基礎的漁民漁夫或跑船等勞力工作，僅能與漁船、漁港、漁貨相處，基本薪資低落無法維持生計出路不易，實際上畢業生多進入公部門及教育研究單位，起薪範圍介於4-5萬。

生態學不僅學習生物資源調查和標本採集工作，近年生態學使用的工具與分析方法有大幅進展，如遙測與地理資訊、DNA條碼、數學模型、基因體之大數據分析、無線電追踪、無人機調查、高速攝影、X光繞射等，探討問題也不斷創新，涵蓋遺傳、演化、物種、生態系、地景、一直到整個生物圈的多樣性維持與對人類生活之影響評估。

本系常常被誤解，教學內容強調漁撈作業，不講求保育與管理。本系之教學內容在於以瞭解漁業產業、海洋環境以及管理層面之相關議題，並探討資源變動與環境變遷之相互影響以提供制定相關管理政策之依據。然而，過去外界長期誤解本系之教學內容偏重漁撈作業之勞務領域，而忽略了保育管理、政策法規、社會經濟等相關議題。

本系生態組強調將課堂知識與生活自然結合。專題課程讓學生進入老師研究室，與師長、同儕互動，進行兩年專題研究，將科學研究步驟觀察、問題、假設和驗證，落實並應用於臺灣各地與海外生態系研究，如金門、墾丁等陸域生態系和東沙、綠島等海域生態系，過程培養獨立思考與解決問題能力。

本系之生學就業出路如附件檔補充說明
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