本系師資涵蓋生物學、輔具設計、生醫材料、AI、生醫電子、IoT物聯網、生理感測、臨床醫學等專長。教學方向分為智慧醫療、醫學材料應用。與醫生、治療師等專業人員聯合授課，培養學生實作經驗與檢測能力。設有多間檢測實驗室教學，期許學生畢業後報考醫學工程師、CAD及IoT等證照，增加學生就業與升學機會。

本系現有大學部及研究所（包含系統生物與生物資訊碩博士班、生物醫學工程碩博士班，及跨領域轉譯醫學博士班）。
因應當前社會需求及生物科技與醫療照護產業的發展趨勢，以培育生醫產業跨領域人才為目標，並基於「破壞性創新」的概念，營造整合基礎研究、技術研發，與產學合作的教學研究環境。

本系著重扎實的工程訓練與醫學涵養，以工程技術解決生物醫學及臨床的議題，發展創新的人工智慧、醫學影像技術、生理感測元件、IoT與穿戴裝置、醫學材料及醫療產品設計。其特色實驗包含如生醫材料檢測、醫療資訊與電子、物聯網、智慧醫療輔具檢測，學習內容符合就業市場需求，以因應生物科技與醫療照護產業的發展趨勢。

本系：生醫科學與工程學系，旨於培育學生成為生物醫學、生物科學、生醫工程，以及生醫技術之跨領域多元人才。
企望學生得以在醫學、科學以及工程三方面互惠研究平台上，成為我國與全球生物技術跨領域整合、發揮與推廣之特徵代表人物。

本系整合工程、生物醫學、醫學電子與資訊及臨床應用的教學方向，以工程方法解決生物醫學問題，致力於實現醫學普及與智慧醫療的目標。教學方向分成二大類(二選一) : (1)智慧醫療(2)醫學材料應用，教學內容包含基礎醫學、生理學、生物學、普物普化，而(1)智慧醫療: AI、生醫感測、影像處理技術、3D列印與掃瞄、智慧輔具、醫用感測器、感測元件醫學應用、保健電子裝置。(2)醫學材料應用:生物醫學檢測、高分子生醫材料、表面鍍膜技術、材料分析與檢測、電腦輔助設計、鈦合金器械等知識，可以學習到醫學領域不可或缺的專業職能。

本系著重各項科學(含基礎科學、人文科學或社會科學等)跨領域知識與技術之整合，學生們需熟稔專精於高中程度不同領域的各種科學知識(但毋貪多，精熟方為要領)，爾後嘗試將其融會貫通、截長補短進行整合，並且有明確的實踐場域或對象。
例如將人文科學與人工智慧結合，因此產生具備分析詩句能力的AI方法；或是將音樂素養與人工智慧相結合，因此產生可分析樂曲風格的AI方法；抑或是將物理學與人工智慧相結合，因此產生可把物理運動視覺化的成果等。
針對各領域知識，學生必須具備對其之解析與演繹能力，並且能親手實踐操作、規劃實驗架構、產生有意義成果。以上範例僅供參考，本系期待學生能將科學創意與想像空間發揮至極致。

與本系相似的科系包含「生物醫學工程」、「生醫科學與工程」等系。本系是將工程技術應用於醫學相關領域上，包括生醫材料、醫學影像、醫學量測與儀表、生理訊號與感測、AI、物聯網、智慧輔具設計、醫學電子等。而生科系或生物醫學系著重在基因、染色體、蛋白、食品、酵素與生化工程的應用與發展，與醫學工程學習有所差異。

本系課程模組涵蓋資料科學、分子與基因體醫學、腦與心智科學、生醫電子、以及材料科學，因此能在適才適所前提下提供學子們跨領域之整合生醫科學與工程培育處方。簡言之，本系特色教學綜合以系統生物的技術方法研究生醫問題、將科學工程原理與技術運用於醫事操作，以及臨床醫學導向的轉譯醫學研究等方面，落實資源整合並強化針對產業需求的基礎研發能量。

本系畢業學生的出路主要從事生醫、生技、醫療法規、生醫訊號、物聯網、AI人工智慧、醫療器材研發相關的工程師。學生畢業後從事生醫產業、生技產業、醫藥產業、醫療器材產業以及在醫院工作或報考公家機關，亦可繼續深造生物醫學工程碩士班。

本系出路與生涯發展明確，將朝生物醫學科學與技術開發前進。

醫工系常與生物科技系、生物醫學系等學系混淆。然而本系著重扎實的工程科技與醫學知識訓練，幫助學生在專業涵養及培訓醫學工程師考照及IoT物聯網國際證照，讓學生獲得充分教學環境與設備進行醫學工程領域的培育，可應用於解決生物醫學及臨床的議題。

本系教學之電子電路設計其他電子電機類學系所教授之最大不同在於：本系課程著重於生理訊號分析所需之電子電路架構與演算法設計，如應用於生理腦電訊號(EEG)以及心電波訊號(ECG)、人體慣性感測訊號等。本課程將依循相關法規來擬訂設計方針。

醫學工程相關產業正如以前台灣半導體產業起飛階段，台灣現有優質的醫學與工業技術基礎，有利於醫療產業發展。本系培養的醫工的跨領域專業人才符合產業人才需求，其發展特色如：智慧醫療與醫學影像、醫學材料與應用、醫療產品設計與研製。每個學生自大一起有自己的師徒師及班級導師，一方面輔導課業學習，一方面在充足生醫工程領域教學環境引導學生學習專業，根據興趣建議學生的選修課程及職涯發展的方向。

本系除傳統生物醫學技術，亦納入資料科學以協助架構下一新世代對於大數據在生醫領域應用之基石。

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