本系1955年成立，以培養高科技產業人才、拓展人類知識疆域、促進科學與社會對話為辦學宗旨。師資優良、設備完善，學、碩、博三學制齊備，創新研究表現傑出，媲美國立大學。透過動手實作、獨立研究、溝通表達等教學訓練，培養解決問題的能力、提供實習與就業的直通管道。畢業生表現優異，系友遍及半導體、光電等高科技產業，及國內外教育學術等機構。

本系發展特色條列如下:

　（一）著重「綠色科學」及「奈米科學」人才的培養。

　（二）與地方政府、學校、研究機構與產業界合作共同發展臺東。

　（三）傳承發展科學教育的使命，培養臺東科學教育人才。

　（四）加強學生基礎科學的涵養與實務課程，以強化就業競爭能力。

應用物理學是自工業革命以來，人類社會歷次產業革命的主要推力。指以物理學為基礎，開發出應用於半導體、光電、材料、通訊、航太、AI、量子資訊等領域的技術。結合物理理論、實驗操作、程式設計、數據分析等能力，以瞭解各種應用科技的原理、開發改善現有科技的方法、進而研發創新應用，為高科技產業發展之基礎。

物理學是自然科學中最基礎的學科，化學和生物學等科學乃至工程學科如光電、材料、電機等都是建構於基礎物理之上，因此學習物理是相當聰明的選擇，本系應用物理組的畢業學生絕大多數都能進入國內外大學之理工、光電、電機及資訊研究所繼續深造，或至科技產業發揮所學，除了完滿個人成就，對社會與國家建設亦能做出重大貢獻。

本系一大特色就是提供大量線上學習資源。這網路時代，建議必要養成透過網路尋找學習資源並加以運用的習慣。目前網路上可以搜尋得到大量以文字或視頻來介紹物理相關科學的網站或頻道，建議養成定期觀看、並與課堂所學相互佐證的習慣。此外由於許多優質科學頻道皆以英文為溝通媒介，建議網路學習時，一併利用機會加強英文能力。
本系強調的另一重點就是實作，包含實驗與專題等。這是傳統高中培育較為缺乏的部份。建議於高中學習時，注重實驗，對實驗結果的分析與討論不可輕忽，切不可有湊數據、敷衍了事的態度。要把握高中開設的自然科學統整主題式課程，從實踐中逐步養成問題發掘、動手實作與結果分析的能力。這對大學科學的學習，也至關重要喔！

參加科學營與科學競賽

應用物理與電機工程在課程與研究內容相當接近，兩系的畢業生都很適合從事半導體、光電、能源等產業相關的工作。兩系課程都包含基礎物理、工程數學、電磁學、近代物理。電機系的專業課程有更多電子電路分析設計與資通訊科技，而應用物理系的進階課程則為量子物理、固態物理與光電物理。近年由於技術進步，電機系的專業也逐漸需要用到更深入的進階物理理論。

應用科學系應用物理組更強調基礎物理與生活科學應用的結合，佐以綠色奈米科學，將物理學知識應用於工程學科，包含光電、電子、材料、化工、機械等，讓學生能夠適才適性發展出自己的專長與特色。
本校雖位處偏遠，但本系師資及學習資源並不亞於西部其他相關科系，學生就讀本校，劣勢亦可為優勢，於優美的圖書館與校園環境下，呼吸最乾淨的空氣，成就個人學習興趣與未來專業，是其他大學所沒有的優勢。
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許多人以為物理系或應用物理系的出路只能當老師或是科學家。事實上應用物理系培養的人才十分受高科技產業歡迎，因為應用物理系的學生就有很強的理解能力，可以將問題簡化，並根據物理專業提出解決方法。畢業生大部分都是進入高科技產業擔任工程師與主管；由於基礎訓練紮實，轉換到傳產、金融、服務業的成功案例也比比皆是。
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高中生最容易誤解物理系畢業後找不到工作，事實上，目前科技職場主要人力皆為碩士學歷，僅有大學學歷已不符合職場需求，因此大學就讀基礎科系，強化自身基礎科學知識，研究所選擇工程學科才是最佳的選擇，物理為工程科學基礎，擁有充實的物理知識，才能應付工程相關研究所創新應變、解決困難的需求。
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很多學生以為物理系的學習內容是整天推導數學公式，實際上，觀察自然、實驗操作、程式模擬、團隊協作、溝通表達等面向的能力也同等重要。本系開設各種專業與跨域課程，培養學生成為具有上述能力的多元化科技人才。

本系課程以物理學為基礎，延伸專業模組課程涵蓋光電、材料、電子、機械、地球科學等領域，讓學生有充分的機會可以選擇自己興趣學科學習，除了畢業後可以報考基礎科學與應用科學等工程類之研究所，也易於找到適合自己未來的工作方向。

本系由十位專任教師組成家族制導師。協助學生適應大學生活，輔導學生學習，分享職涯經驗。規劃物理入門、物理新知及論文專題課程，引領低年級學生認識物理學的基本內涵與最新發展，並輔導其順利銜接學習高中至大一與大一至大二的專業課程；高年級學生則鼓勵參與教師的研究工作，為未來繼續深造或投入職場奠定基礎。

本系分為[應用物理組]和[奈米科學及化學組]，修讀本系可以充分選修兩組間的所有課程，並且部分課程由化學及物理老師共同開課，學生可以很快培養個人對部分學科的興趣，並強化自己的學習目標
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