本系擁有堅強之師資陣容及完善的設備，在土壤環境、植物營養、微生物學及食品化學與加工具有堅實史績與成果，是臺灣唯一的農業化學系，並提供出國研修交換計畫及攻讀雙聯學位等學習機會，亦設立研究所，學生有持續進修管道，系友於產業界、學術界及公部門等均有優秀表現。

生物醫學工程研究範圍極為廣泛，除基礎工程專業課程學習外，更特別著重實驗課程，在大學部即可享有與醫工所研究生一同使用頂級研究實驗設備的機會，提供與其他工程科系不一樣的養成教育。另外，由於本系設在於工學院下，為使學生對醫學領域有更進一步的瞭解，尤其是醫院的臨床工作，本系課程中至成大醫學中心見習與合作，讓學生能確實瞭解實際臨床醫學的運作。

農業化學系是「以化學為基礎及工具，探索生物相關的問題與產業應用」，教學研究包括土壤環境科學、植物生理與化學、微生物與生物技術及生物資源利用，應用於農業生產環境保護及生物資源永續利用以提高人類生活品質。

生物醫學工程系(簡稱醫工系)，廣義而言，即是將工程技術應用於生物學與醫學上，發展延伸出更新的技術與設備，以造福廣大的人群；醫工的領域為整合物理、化學、數學、生物醫學科技與臨床應用而形成的一項跨領域工程科學。

1.
可嘗試從化學的反應過程去了解生物與環境現象的探索，尤其是土壤、植物與微生物。
2.
對於化學實驗數據的產生，要融入基本的品保與品管概念，例如重複性、準確度與精密度，同時可準備簡單的統計概念。
3.
透過實驗活動或產業體驗來想像上述的學期過程。

在閱讀各個學科與知識時，除了基礎原理外，也需要探索其應用面，以了解如何應用基礎知識在解決實際問題或治療疾病
需要具備歸納與融會貫通的能力，可以透過和同學交流、撰寫科學短文或實驗報告加強此能力
英文的聽說讀寫能力亦需要強化，可藉由長期閱讀英文書籍、英文影片、聆聽podcast逐漸深化

本系以化學為基礎及工具，探索生物相關的問題與產業。以化學的方法檢視農業上的行為，再將成果應用到農作物相關產業、食品及醫藥等。
化學系較著重於實驗科學，本系在化學及生物的基礎科學訓練紮實，可應用至土壤環境、植物營養、微生物及食品等實務。
生化科技系偏重分子生物相關原理之學習，而本系則以化學與生物知識及技術進行更深入的探索及問題解決。

醫工系與生科及醫學相關科系的差異在於其更注重工程技術原理的學習，如電子、電機、機械、材料、化學等工程專業，應用於創造生物醫學技術的突破與革新。醫學工程是成就醫學領域的重要推手，沒有醫學工程的後盾，便無法實現醫學普及的目標。

學生以為畢業只能在實驗室、農場或是做食品加工類型的工作，誤以為僅能從事跟農業相關的職業。
本系就業管道有: 大專院校及研究所教師、各公私立研究單位技術人員、藥品與食品研發人員、環境監測檢驗技師、工程顧問公司技術人員、專利師等及公務員如農業化學、農業技術、化學工程、環境工程、食品技師、生物技術等。

醫工系的畢業出路常與醫師、檢驗師、治療師等混淆。因多元專業的緣故，超過半數的學生畢業後會繼續進入研究所進修，而出路也較傳統科系更為寬廣，如醫療器材工程師、醫用軟體發展工程師或生醫專利工程師等。

因為系名的關係，容易讓人以為是種田或農藥肥料為主的科系。
本系教學著重化學與生物相關科學基礎教育，強化實驗課程功能，進行實作與研習，並輔以專題討論與專題研究的學習，使本系大學部畢業生具備實驗室研究經驗。

醫工系常與醫學系、生科系、生物醫學等學系混淆。成大醫工系隸屬工學院，著重扎實的工程思維與訓練，幫助學生在專業涵養上護得特定領域的培育，應用於解決生物醫學及臨床的議題，如生醫材料、生醫機械、生醫電子等。

1.
加強宣導與生農學院其他科系的不同及強調在化學及生物基礎學習方面的重視。
2.
對本系課程及未來出路有更明確、詳細介紹，讓有意就讀本系的學生參考，及早規劃適合自己的抉擇。
3.
鼓勵學生參加本系活動如學系博覽會、農化營等。

台灣高階產業目前正處於轉型階段，建康照護產業在高齡化社會，需求持續增高，以台灣現有工業基礎，醫工系培養的跨領域專業人才，正如同三十年前台灣半導體產業起飛階段，正可帶領台灣迎接下一世代的產業挑戰。

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