本系現有大學部及研究所（包含系統生物與生物資訊碩博士班、生物醫學工程碩博士班，及跨領域轉譯醫學博士班）。
因應當前社會需求及生物科技與醫療照護產業的發展趨勢，以培育生醫產業跨領域人才為目標，並基於「破壞性創新」的概念，營造整合基礎研究、技術研發，與產學合作的教學研究環境。

中國醫藥大學生物醫學工程學系是國內中部擁有醫療大健康的基礎師資與附設醫院醫學中心等級臨床資源的學系。本系師資結合了校內生醫工程基礎教師、附設醫院臨床主治醫師/教授。本系特色為利用多維列印與AI大數據兩大方式來達到精準健康醫療之目的。

本系：生醫科學與工程學系，旨於培育學生成為生物醫學、生物科學、生醫工程，以及生醫技術之跨領域多元人才。
企望學生得以在醫學、科學以及工程三方面互惠研究平台上，成為我國與全球生物技術跨領域整合、發揮與推廣之特徵代表人物。

生物醫學工程是結合工程學群與生命科學學群跨領域的多元學科，主要涵蓋｢醫用電子｣、｢生物力學｣、｢生醫材料｣、｢醫學資訊與影像｣、｢醫材輔具｣等領域，需學習跨領域之基礎知識並培養以工程角度務實解決生物學及醫學領域的科學問題。

本系著重各項科學(含基礎科學、人文科學或社會科學等)跨領域知識與技術之整合，學生們需熟稔專精於高中程度不同領域的各種科學知識(但毋貪多，精熟方為要領)，爾後嘗試將其融會貫通、截長補短進行整合，並且有明確的實踐場域或對象。
例如將人文科學與人工智慧結合，因此產生具備分析詩句能力的AI方法；或是將音樂素養與人工智慧相結合，因此產生可分析樂曲風格的AI方法；抑或是將物理學與人工智慧相結合，因此產生可把物理運動視覺化的成果等。
針對各領域知識，學生必須具備對其之解析與演繹能力，並且能親手實踐操作、規劃實驗架構、產生有意義成果。以上範例僅供參考，本系期待學生能將科學創意與想像空間發揮至極致。

三大方向
自主學習：除了學校所教授之專業課程，同時關心時事與科技，持續不斷學習。
團隊合作：在分組的作業中，學習如何與同儕建立良好互動，並且從中建立自主學習的氛圍達到更好的學習效益。
實作能力：抱持對事物的好奇心並且同時培養動手做的實力。

本系課程模組涵蓋資料科學、分子與基因體醫學、腦與心智科學、生醫電子、以及材料科學，因此能在適才適所前提下提供學子們跨領域之整合生醫科學與工程培育處方。簡言之，本系特色教學綜合以系統生物的技術方法研究生醫問題、將科學工程原理與技術運用於醫事操作，以及臨床醫學導向的轉譯醫學研究等方面，落實資源整合並強化針對產業需求的基礎研發能量。

生物學系、醫學系與生物醫學工程學系的差別簡單講就是生物學系與醫學系偏重在生物醫學知識的理論與研究，而生物醫學工程學系偏重在將工程方法應用於解決生物醫學的臨床問題，比如: 3D列印與組織工程技術、生醫材料開發、醫療器材產業、醫療人工智慧、醫療大數據分析等。因此，生物醫學工程學系會較側重於理工、資訊、統計、電子電路學科的訓練。

本系出路與生涯發展明確，將朝生物醫學科學與技術開發前進。

生醫工程學系學生的職涯發展，除了擔任醫療院所的醫工師外，還有其他多元出路，例如：國內醫療器材研發廠商、生醫科技學研機構研究人員、國外醫療器材大廠在臺灣的外商公司或代理商公司...等、此外亦可參加高等考試的醫學工程職系成為公務員。

本系教學之電子電路設計其他電子電機類學系所教授之最大不同在於：本系課程著重於生理訊號分析所需之電子電路架構與演算法設計，如應用於生理腦電訊號(EEG)以及心電波訊號(ECG)、人體慣性感測訊號等。本課程將依循相關法規來擬訂設計方針。

一般人容易以為生醫工程學系的學習內容就只是修理醫療儀器設備所需的電子電路知識，其實不然。在現今人口高齡化與醫療技術數位化的時代，所急需發展的醫療大健康產業，不只局限於醫院中，而是可能遍及於世界的各個角落。遠距長照、精準醫療、醫材開發等領域所需求的人才，還需具備數據探勘、軟體開發等軟實力。

本系除傳統生物醫學技術，亦納入資料科學以協助架構下一新世代對於大數據在生醫領域應用之基石。

生物醫學工程是國內5+2重點發展產業之一，而中國醫藥大學暨附設醫院是國內中部少數擁有醫療大健康的基礎師資與醫學中心等級臨床資源的醫學大學。中國醫藥大學水湳校本部的生醫園區擴建，以及未來與中部醫療科技產業園區的結合，所產生龐大的生醫產業聚落效應，將提供學生最豐沛的學習資源與就業管道。

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