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本系現有大學部及研究所（包含系統生物與生物資訊碩博士班、生物醫學工程碩博士班，及跨領域轉譯醫學博士班）。
因應當前社會需求及生物科技與醫療照護產業的發展趨勢，以培育生醫產業跨領域人才為目標，並基於「破壞性創新」的概念，營造整合基礎研究、技術研發，與產學合作的教學研究環境。

生物醫學科技學系生醫工程組主要在培育智慧醫療與精準健康產業所需的跨域高階人才，跨域課程包括：生醫、工程、資訊、法規，以問題導向訓練，著重專題實作之總結性整合式課程（Capstone Course），以因應日後生物醫學基礎研究、智慧醫療器材開發、生醫大數據分析、國際人才流動的專業能力需求。

本系：生醫科學與工程學系，旨於培育學生成為生物醫學、生物科學、生醫工程，以及生醫技術之跨領域多元人才。
企望學生得以在醫學、科學以及工程三方面互惠研究平台上，成為我國與全球生物技術跨領域整合、發揮與推廣之特徵代表人物。

生物醫學工程學為橫跨「生物醫學」及「工程科學」兩項領域，歸類工程學類：生醫工程，此學類學習層較廣是將生醫材料、生醫電子與資訊、化工、生物醫學、生物資訊等相關科技應用於醫療診斷、臨床治療、人體工學。

本系著重各項科學(含基礎科學、人文科學或社會科學等)跨領域知識與技術之整合，學生們需熟稔專精於高中程度不同領域的各種科學知識(但毋貪多，精熟方為要領)，爾後嘗試將其融會貫通、截長補短進行整合，並且有明確的實踐場域或對象。
例如將人文科學與人工智慧結合，因此產生具備分析詩句能力的AI方法；或是將音樂素養與人工智慧相結合，因此產生可分析樂曲風格的AI方法；抑或是將物理學與人工智慧相結合，因此產生可把物理運動視覺化的成果等。
針對各領域知識，學生必須具備對其之解析與演繹能力，並且能親手實踐操作、規劃實驗架構、產生有意義成果。以上範例僅供參考，本系期待學生能將科學創意與想像空間發揮至極致。

本學系是一個跨領域的學科，所以學生需要具備生醫科學與工程的基本知識，尤其在材料科學、電子電路、人工智慧與資訊科技等，建議學生以專題研究來加強自己所學的知識，透過自己發現問題，嘗試解決回答它，將有助於提升自己的觀察力，歸納與融會貫通的能力，同時也能培養動手做的實力，此外，與國際接軌一直是做個材料科技人需要具備的能力，因為需要提升英文的聽說讀寫能力，以降低未來在面臨英文授課時的壓力。

本系課程模組涵蓋資料科學、分子與基因體醫學、腦與心智科學、生醫電子、以及材料科學，因此能在適才適所前提下提供學子們跨領域之整合生醫科學與工程培育處方。簡言之，本系特色教學綜合以系統生物的技術方法研究生醫問題、將科學工程原理與技術運用於醫事操作，以及臨床醫學導向的轉譯醫學研究等方面，落實資源整合並強化針對產業需求的基礎研發能量。

醫學工程學系注重整合工程學知識，致力於醫療器械、影像技術等設備的開發與改進，強調工程技術在醫學中的應用。生物科技系則側重於生物科學研究，包括分子生物學、細胞生物學等，並應用於制藥、生物製程等領域，專注於生物產品的製造和開發。

本系出路與生涯發展明確，將朝生物醫學科學與技術開發前進。

醫學工程侧重于醫療器械和技術的研發，整合工程和醫學知識以提升醫療水準。醫事技術則著眼於臨床實務，包括護理、放射科技等，提供病患基本照護。兩者在醫療領域中扮演不同但相互補充的角色。

本系教學之電子電路設計其他電子電機類學系所教授之最大不同在於：本系課程著重於生理訊號分析所需之電子電路架構與演算法設計，如應用於生理腦電訊號(EEG)以及心電波訊號(ECG)、人體慣性感測訊號等。本課程將依循相關法規來擬訂設計方針。

醫學工程系學生注重工程技術應用，學習電子、機械等相關科目，並透過實驗和研究解決醫療技術問題。醫事技術系學生著重臨床實務操作，學習如護理、放射科技等，強調在現場照護病患的應用。兩者分別強調工程技術和臨床實踐，各自在醫療領域扮演重要角色。

本系除傳統生物醫學技術，亦納入資料科學以協助架構下一新世代對於大數據在生醫領域應用之基石。

本系為跨領域的學系，所以特別適合喜歡動手做實驗與勇於嘗試創新的學生，特別是能團隊合作與表達能力強的學生。