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生物醫學工程研究範圍極為廣泛，除基礎工程專業課程學習外，更特別著重實驗課程，在大學部即可享有與醫工所研究生一同使用頂級研究實驗設備的機會，提供與其他工程科系不一樣的養成教育。另外，由於本系設在於工學院下，為使學生對醫學領域有更進一步的瞭解，尤其是醫院的臨床工作，本系課程中至成大醫學中心見習與合作，讓學生能確實瞭解實際臨床醫學的運作。

本系是全國首創之醫學工程學系(成立於61年)，也是全國第一所通過IEET「工程教育」國際認證的系所。以培育兼具工程及生物醫學知識與實作能力之醫學工程師為導向，強調醫學工程跨領域知識教學和系統整合能力的養成，另推動CDIO創新教學模式。本系師資專長涵蓋生醫材料、奈米醫學、醫學影像、生醫資訊、醫用儀表、生醫訊號、生醫感測、遠距醫療照護並與醫生聯合授課，且與教學醫院及醫療器材等產業進行密切合作研究。

生物醫學工程系(簡稱醫工系)，廣義而言，即是將工程技術應用於生物學與醫學上，發展延伸出更新的技術與設備，以造福廣大的人群；醫工的領域為整合物理、化學、數學、生物醫學科技與臨床應用而形成的一項跨領域工程科學。

「生物醫學工程」乃融合生物醫學及工程科學之跨領域整合性科技。我們戮力於材料、元件、儀器設備及系統研發，助益臨床醫師正確地發現人體症變或使其簡便安全地治療病灶。此外，生醫奈米材料、基因、細胞與組織工程的研究，更將生物科技與醫療科技鏈結在一起，提升醫療與健康照護的創新發展。

在閱讀各個學科與知識時，除了基礎原理外，也需要探索其應用面，以了解如何應用基礎知識在解決實際問題或治療疾病
需要具備歸納與融會貫通的能力，可以透過和同學交流、撰寫科學短文或實驗報告加強此能力
英文的聽說讀寫能力亦需要強化，可藉由長期閱讀英文書籍、英文影片、聆聽podcast逐漸深化

在閱讀各個基礎學科與知識時，除了基礎的原理外，需要更深究其應用面，如何將基礎知識在醫學工程的應用上，此外，因為學科內容豐富且具一定廣度，因此需要具備歸納與融會貫通的能力，建議可以透過參加科學專題來加強此能力，藉由自己發現問題，嘗試解決回答它，將有助於提升自己的觀察力，歸納與融會貫通的能力，同時也能培養動手做的實力。另外，與國際接軌也是做為醫學工程師需要具備的能力，因此需要提升英文的聽說讀寫能力，以降低未來在面臨英文授課時的壓力。

醫工系與生科及醫學相關科系的差異在於其更注重工程技術原理的學習，如電子、電機、機械、材料、化學等工程專業，應用於創造生物醫學技術的突破與革新。醫學工程是成就醫學領域的重要推手，沒有醫學工程的後盾，便無法實現醫學普及的目標。

生物醫學工程是將電子電路、資訊科技、機械控制、化工材料等科技應用於醫學領域，主要將工程原理與、物理化學及生理知識結合，運用在醫療診斷、臨床治療、人體工學之類的領域。
生物科技則較專注於研究生物特性研究或環境對其影響，並加以運用；且結合基因改質等其他技術。

醫工系的畢業出路常與醫師、檢驗師、治療師等混淆。因多元專業的緣故，超過半數的學生畢業後會繼續進入研究所進修，而出路也較傳統科系更為寬廣，如醫療器材工程師、醫用軟體發展工程師或生醫專利工程師等。

生物醫學工程被國際公認為最具發展潛力的行業之一，本系畢業生的出路廣泛，主要在醫療器材產業或醫院，擔任生技/科技公司研發工程師，醫療器材維修工程師、醫院醫工師、醫療器材工程師等，從事醫療器材研發、認證檢測、維護管理或市場銷售等工作，任職單位包含教學研究單位、公家單位、電子產業、資訊產業或服務業等。

醫工系常與醫學系、生科系、生物醫學等學系混淆。成大醫工系隸屬工學院，著重扎實的工程思維與訓練，幫助學生在專業涵養上護得特定領域的培育，應用於解決生物醫學及臨床的議題，如生醫材料、生醫機械、生醫電子等。

大一為共同必修,含微積分、物理、化學、生物、程式語言等。大二涵蓋基礎工程及醫學課程，如:工數、電子、電路、生物化學等。大三除解剖生理學/實驗、醫測儀表實驗、書報討論等，依據三大課組-智慧醫院、數位健康與精準醫療進行課程選修。大四專題研究，3~4人為一組，以團隊方式完成醫療器材開發或解決醫材研發問題。

台灣高階產業目前正處於轉型階段，建康照護產業在高齡化社會，需求持續增高，以台灣現有工業基礎，醫工系培養的跨領域專業人才，正如同三十年前台灣半導體產業起飛階段，正可帶領台灣迎接下一世代的產業挑戰。

本系每個班級都配有三位班級導師，從大一到大四，每一位導師都相當用心在經營與班上同學的鏈結，因此學生在規劃就業或是繼續升學時，都可以找導師討論與輔導。本系也另外安排職涯導師和業界導師，專門負責幫助高年級同學針對大學畢業後是否繼續升學或是就業來進行輔導與規劃。